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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210714247.4 (22)申请日 2022.06.22 (71)申请人 北京积水潭医院 地址 100000 北京市西城区新 街口东街31 号 申请人 北京华诺奥美 基因生物科技有限公 司 (72)发明人 杨征 于超计 王倩玉 冯超 徐云峰 张骥 李闪 魏星 (74)专利代理 机构 成都顶峰专利事务所(普通 合伙) 51224 专利代理师 钱学宇 (51)Int.Cl. C12Q 1/6869(2018.01) C12Q 1/6806(2018.01)C12Q 1/6883(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 肢体发育异常基因检测组合物及应用、 试剂 盒和检测方法 (57)摘要 本发明公开了一种肢体发育异常基因检测 组合物及应用、 试剂盒和检测方法, 属于生物检 测技术领域。 该检测组合物能够一次性检测460 个肢体发育异常基因全部外显子及内含子边界 的±20bp的相 关基因突变, 覆盖425种肢体发育 异常疾病。 利用靶向捕获基因pane l二代测序技 术, 检测结果具有通量高、 成本低、 准确性强、 灵 敏度高、 覆盖变异全等优势, 具有极大临床应用 价值及更开阔的市场推广性。 建库过程通过靶向 杂交捕获原理, 可以更高效地检测出对肢体发育 异常有指导意义的基因突变, 也可以降低基因检 测的成本和实验操作难度, 还能提高测序深度, 增加检测灵敏度, 而且对于一些复杂结构变异和 基因复杂区域具有不可比拟的准确性。 权利要求书1页 说明书13页 序列表19页 附图1页 CN 115216525 A 2022.10.21 CN 115216525 A 1.一种肢体发育异常基因检测组合物, 其特征在于, 所述组合物包括如SEQ ID NO.1‑ 100所示的探针。 2.一种如权利要求1所述肢体发育异常基因检测组合物在制备肢体发育异常基因检测 试剂盒中的应用。 3.一种肢体发育异常基因检测试剂 盒, 其特征在于, 所述试剂 盒包括权利要求1所述的 肢体发育异常基因检测组合物。 4.根据权利要求3所述的肢体发育异常基因检测试剂 盒, 其特征在于, 所述试剂 盒为覆 盖460个肢体发育异常基因的检测产品。 5.一种肢体发育异常基因 的检测方法, 其特征在于, 采用高通量测序法, 利用如权利要 求3所述的肢体发育异常基因检测试剂盒进行检测。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 115216525 A 2肢体发育异常基因检测组合物及应用、 试剂盒和检测方 法 技术领域 [0001]本发明属于生物检测技术领域, 具体涉及 一种肢体发育异常基因检测组合物及应 用、 试剂盒和检测方法。 背景技术 [0002]肢体发育异常是一大类 临床和遗传异质性较强的骨骼系统疾病, 主要的临床表 现 包括骨骼畸形、 矮小、 不成比例生长以及单个或一组骨骼发育不良等。 根据2019年 “国际骨 骼发育不良协会 ”最新指, 共有461种表型被纳入 “肢体发育异常 ”, 包括437个基因。 如成骨 发育不全 是一种发病率较高的肢体发育异常疾病, 发病率约为1/10000 ‑1/20000, 多呈常染 色体显性遗传。 该病的临床表现主要包括骨脆性增加、 易骨折、 骨关节进 行性畸形、 蓝巩膜、 牙本质发育不全及听力下降等特点。 遗传性多发性骨软骨瘤是一种较常见肢体发育异常, 该病为良性骨肿瘤, 发病率约为1/50000多为常染色体显性遗传。 主要表现为骨骼发育异 常, 主要累及长骨, 其次为骨盆和肩胛骨, 四肢长骨骨骺附近常形成大小不等的骨性隆起。 一般 3岁前开始发病, 肿瘤数量和体积会随着年龄而增长。 肿瘤主要生长在关节附近, 可导 致患儿矮小, 并产生前臂畸形以及膝外翻等畸形。 [0003]据统计, 肢体 发育异常约占我国出生缺陷的4% ‑6%, 其发生率约为0.2%, 对于有 肢体畸形家族史的, 其 发生率高达15%。 由以上不难看出, 肢体发育异常单病种的发病率较 低, 均属于罕见病。 但整体而言发病率 非常之高。 因此, 早 发现、 早诊断、 早干预, 是预防和治 疗该类疾病、 防止患者 发生不可逆转的严重后遗症的重要手段。 建立可靠、 有效的分子诊断 方法, 尽早 发现致病基因突变, 对于肢体发育异常的正确诊断、 分型、 治疗、 产前诊断和遗传 咨询等均至关重要。 [0004]作为最大的骨科医疗单位, 长期从事肢体发育异常相关疾病的诊疗研究。 一直以 来, 我国的肢体发育异常比较注重外科手术治疗方案的研究, 遗传学方面诊断, 近年来随着 全外显子基因检测技术的发展而逐渐被重视, 该方法针对20000万余基因全部外显子进行 检测, 虽然检测范围广, 但是由于包括基因太多, 并不全部适用于肢体发育异常相关基因检 测, 这极大的增加了检测成本和检测分析的难度。 或者有部分少数基因的检测panel, 但是 由于肢体发育异常具有显著的异质性, 具有明显的 “同病症不同基因突变, 同基因突变不同 病症”的特点。 因此, 由此可见, 检测少数基因很难真正满足临床实际需求。 因此, 临床急需 建立一种专门针对肢体发育异常的、 低成本、 准确性高、 覆盖度 广的基因检测的试剂盒。 发明内容 [0005]为了解决现有技术存在的上述问题, 本发明目的在于提供一种肢体发育异常基 因 检测组合物及应用、 试剂盒和检测方法。 [0006]本发明所采用的技术方案为: 一种肢体发育异常基因检测组合物, 所述组合物包 括如SEQ ID NO.1‑100所示的探针。 [0007]上述本发明提供的该检测组合物能够一次性检测460个肢体发育异常基因全部外说 明 书 1/13 页 3 CN 115216525 A 3
专利 肢体发育异常基因检测组合物及应用、试剂盒和检测方法
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