(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210689843.1 (22)申请日 2022.06.17 (71)申请人 湖北省农业科 学院中药 材研究所 地址 445000 湖北省恩施市学院路25 3号 (72)发明人 游景茂　王帆帆　唐涛　段媛媛　 郭晓亮　郭杰　 (74)专利代理 机构 北京高沃 律师事务所 1 1569 专利代理师 吴波 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12Q 1/686(2018.01) C12N 15/11(2006.01) C12R 1/645(2006.01) (54)发明名称 白绢病菌特异性S SR标记及其应用 (57)摘要 本发明提供了白绢病菌特异性SSR标记及其 应用， 属于分子生物学技术领域。 本发明在测定 白绢病菌菌丝亲和群的基础上， 基于白绢病菌转 录组测序结果， 进行SSR位点搜索和SSR引物设 计， 筛选出9对适用于白绢病菌的SSR引物， 并利 用SSR分子标记对白绢病菌的遗传多样性和群体 结构进行研究， 能够从分子水平上确定植物白绢 病菌的传播途径， 对指导植物白绢病防治有重要 意义。 权利要求书1页 说明书13页 序列表3页 附图6页 CN 114934130 A 2022.08.23 CN 114934130 A 1.植物白绢病菌SSR标记， 其特征在于， 所述SSR标记由以下任意一个或几个引物对扩 增得到， 所述引物对的序列如SEQ  ID NO： 1～2、 SEQ  ID NO： 3～4、 SEQ  ID NO： 5～6、 SEQ  ID  NO： 7～8、 SEQ  ID NO： 9～10、 SEQ  ID NO： 11～12、 SEQ  ID NO： 13～14、 SEQ  ID NO： 15～16、 SEQ ID NO： 17～18所示。 2.植物白绢病菌的SSR标记引物对， 其特征在于， 包括以下任意一个或几个引物对： 所 述引物对的序列如SEQ  ID NO： 1～2、 SEQ  ID NO： 3～4、 SEQ  ID NO： 5～6、 SEQ  ID NO： 7～8、 SEQ ID NO： 9～10、 SEQ  ID NO： 11～12、 SEQ  ID NO： 13～14、 SEQ  ID NO： 15～16、 SEQ  ID NO： 17～18所示。 3.一种植物白绢 病菌检测试剂盒， 其特 征在于， 包括权利要求2所述S SR标记引物对。 4.根据权利要求3所述的试剂盒， 其特征在于， 所述试剂盒还包括dNTPs、 Taq  DNA聚合 酶、 PCR反应缓冲液和基因 组提取试剂。 5.根据权利要求 4所述的试剂盒， 其特 征在于， 所述试剂盒还 包括毛细电泳中的试剂。 6.权利要求1所述引物对或权利要求3～5任意一项所述的试剂 盒在植物白绢病菌检测 中的应用。 7.权利要求1所述引物对或权利要求3～5任意一项所述的试剂 盒在植物白绢病菌遗传 多样性和群 体结构分析中的应用。 8.权利要求1所述引物对或权利要求3～5任意一项所述的试剂 盒在植物白绢病菌源中 心确定中的应用。 9.权利要求1所述引物对或权利要求3～5任意一项所述的试剂 盒在确定植物白绢病菌 传播途径中的应用。 10.权利要求1所述引物对或权利要求3～5任意一项所述的试剂盒在植物白绢病防治 中的应用。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114934130 A 2白绢病菌特异性S SR标记及其应用 技术领域 [0001]本发明涉及分子生物学技术领域， 具体涉及一种白绢病菌特异性SSR标记及其应 用。 背景技术 [0002]白绢病是一种毁灭性的土传病害， 目前报道其寄主超过500种植物， 主要危害双子 叶植物， 同时也危害部 分单子叶植物， 包括粮食作物和经济作物， 白绢病菌主要侵染植物的 根茎， 造成根腐或者茎腐。 白绢病菌无性态为齐整小核菌， 属无性孢子类， 丝孢纲， 无孢目， 小核菌属； 有性态为罗氏阿太菌， 属担子菌门， 多孔菌目， 膏药菌科。 白绢病菌侵染初期， 染 病部位黑褐色， 温湿度适宜， 染病部位扩大， 可见白色菌丝。 随着侵染加重， 根茎部皮层腐 烂， 影响营养物质及水分等传输， 最终导致植株枯死。 侵染末期， 在侵染部位及土壤表层出 现大量褐色菜籽样菌核。 [0003]遗传多样性可以反映一个物种的适应性。 目前比较普遍的遗传多样性研究方法包 括形态学标记、 细胞学标记、 生物 化学标记、 免疫 学标记、 生物化学标记和分子标记等。 分子 标记更能从微观反映生物群体的遗传 多样性， 其中SSR分子标记 技术具有多态 性高、 结果精 准、 单碱基 分辨率高、 信息量高、 呈共显性、 重复性好、 样 本DNA使用量低的特点， 被认为是目 前比较精准的标记方式， 已被广泛的应用于植物病原菌群体间遗传距离、 进化和多样性分 析等研究。 [0004]SSR分子标记主要包括基因组SSR和表达序列标签SSR。 前者从基因组开发SSR引 物， 其分析数据量大、 步骤复杂、 开 发成本高， 需要较强的数据分析能力。 后者基于转录组等 测序得到SSR引物进 行相关研究， 具有步骤简单、 成本较低等诸多优点。 因此， 利用病原菌的 转录组数据开发SSR标记是较为经济、 有效的DNA分子标记方法。 然而， 目前国内外无白绢病 菌SSR分子标记的相关报道。 发明内容 [0005]为了解决现有技术中存在的问题， 本 发明的目的在于提供植物白绢病菌SSR标记， 具体包括9对引物对， 可用于植物白绢病菌的检测、 遗传多样性和 群体结构分析、 菌源中心 和传播途径的确定以及植物白绢 病的防治。 [0006]为了实现上述发明目的， 本发明提供以下技 术方案： [0007]本发明提供了植物白绢病菌SSR标记， 所述SSR标记由以下任意一个或几个引物对 扩增得到， 所述引物对的序列如SEQ  ID NO： 1～2、 SEQ  ID NO： 3～4、 SEQ  ID NO： 5～6、 SEQ   ID NO： 7～8、 SEQ  ID NO： 9～10、 SEQ  ID NO： 11～12、 SEQ  ID NO： 13～14、 SEQ  ID NO： 15～ 16、 SEQ ID NO： 17～18所示。 [0008]本发明还提供了植物白绢病菌的SSR标记引物对， 包括以下任意一个或几个引物 对： 所述引物对的序列如SEQ  ID NO： 1～2、 SEQ  ID NO： 3～4、 SEQ  ID NO： 5～6、 SEQ ID NO： 7 ～8、 SEQ ID NO： 9～10、 SEQ  ID NO： 11～12、 SEQ  ID NO： 13～14、 SEQ  ID NO： 15～16、 SEQ  ID 说　明　书 1/13 页 3 CN 114934130 A 3