(19)国家知识产权局
(12)发明 专利申请
(10)申请公布号
(43)申请公布日
(21)申请 号 202210578688.6
(22)申请日 2022.05.25
(71)申请人 三亚中国检科院生物安全中心
地址 572025 海南省三 亚市崖州区科技城
标准厂房二期三楼C268区
申请人 中国检验检疫科 学研究院
中国农业大 学
(72)发明人 田茜 罗来鑫 赵文军 方雪阳
马云龙 孙羽佳
(74)专利代理 机构 北京市中伦律师事务所
11410
专利代理师 信建
(51)Int.Cl.
C12N 15/11(2006.01)
C12Q 1/689(2018.01)C12Q 1/6844(2018.01)
C12R 1/01(2006.01)
(54)发明名称
用于检测水稻细菌性谷枯病菌的组合产品
及试剂盒
(57)摘要
本发明涉及分子生物学技术领域, 具体而
言, 涉及一种用于检测水稻细菌性谷枯病菌的组
合产品及试剂盒。 该组合产品包括上游引物、 下
游引物和探针, 可配合等 温核酸扩增体系进行使
用。 本发明所提供的组合产品及试剂盒检测灵敏
度和特异性均较高, 且检测方便, 耗时较短。
权利要求书1页 说明书9页 附图3页
CN 114958835 A
2022.08.30
CN 114958835 A
1.组合产品, 包 含:
上游引物: TCGCTCTC CCGAGGGAGATGACAGC CGCTACA;
下游引物: ACACG GAACACCTGGGTAGTCTCTGTAG GGAAG; 以及
探针: CCATCTCAAATAAGCGCTTCCGCTATCCACTXTACTACT TCTTCCAGAT;
其中所述探针为基于重组酶聚合酶扩增技术的探针, 第31位碱基T标记发光基团, 第32
位X为脱碱基核苷 酸类似物, 第33位碱基T标记淬灭基团, 3 ’端进行阻断剂修饰; 所述阻断剂
用于阻断探针的聚合酶延伸。
2.根据权利要求1所述的组合产品, 所述脱碱基核苷酸类似物为四氢呋喃。
3.根据权利要求1所述的组合产品, 所述阻断剂为间臂, 优选 C3间臂。
4.根据权利要求1所述的组合产品, 所述发光基团为FAM, 所述淬灭基团是BHQ。
5.试剂盒, 其包 含权利要求1~4任一项所述的组合产品。
6.根据权利要求5所述的试剂盒, 其还包含核酸提取试剂、 等温核酸扩增所用试剂、 阳
性对照和阴性对照中的一种或多种。
7.根据权利要求6所述的试剂盒, 所述等温核酸扩增所用试剂包括能结合单链核酸的
重组酶、 单链DNA结合蛋白、 链置换DNA聚合酶、 辅助蛋白、 核酸外切酶III、 反转录酶、 ATP、
ATP再生体系所用试剂、 pH调节剂、 dNTP、 各种分子量分布的BSA和/或PEG、 DTT以及水中的一
种或多种;
其中所述辅助蛋白用于改变重组酶 ‑引物复合体解离及重新结合的可逆反应过程, 使
反应向更有利于等温核酸扩增进行。
8.根据权利要求7 所述的试剂盒, 所述重组酶选自uvsX和/或RecA;
可选地, 所述单链DNA结合蛋白为gp32;
可选地, 所述链置换DNA聚合酶选自BSu DNA聚合酶和/或Sau DNA聚合酶;
可选地, 所述辅助蛋白选自uvsY;
可选地, 所述ATP再生体系所用试剂选自镁离子、 磷酸肌酸及其平衡离子、 肌酸激酶、 肌
激酶、 焦磷酸酶、 蔗糖以及蔗糖磷酸 化酶中的一种或多种。
9.根据权利要求6~8任一项所述的试剂 盒, 所述等温核酸扩增所用试剂为冻干粉试剂
或混合的液体试剂。
10.权利要求1~4任一项所述的组合产品, 或权利要求5~9任一项所述的试剂盒在检
测中的应用。
11.根据权利要求1所述的应用, 检测在恒温扩增的条件下进行, 温度为37℃~42℃, 反
应时间≥20mi n。权 利 要 求 书 1/1 页
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2用于检测水稻细菌性谷枯病菌的组合产品及 试剂盒
技术领域
[0001]本发明涉及分子生物学技术领域, 具体而言, 涉及一种用于检测水稻细菌性谷枯
病菌的组合产品及试剂盒。
背景技术
[0002]水稻细菌性谷枯病菌是黄单胞属的革兰氏阴性细菌, 是引起水稻细菌性谷枯病
(bacterial panicle blight ofrice,BPBR)的病原菌, 该病害最早在日本发现, 目前蔓延
至东南亚, 美洲, 非洲部分地区, (CABI)。 国内2007年首次在无症状谷粒中检出水稻细菌性
谷枯病菌(J.Luo et.al.,2007), 2020年首次在南方稻田有症状病叶中检出水稻细菌性谷
枯病菌(Y.Hou et.al.,2020), 目前该病害在国内呈零星分布。 在田间接种试验中细菌性谷
枯病可导致高达75%产量损失; 一项美国的研究中证明, 随着全球变暖, 细菌性谷枯病侵染
面积将增大, 导致减产增多, 在3℃升温下, 水稻细菌性谷枯病预计额外造成每年2.04亿美
元损失(Shew AM et.al.,2019)。 水稻细菌性谷枯病菌严重威胁到粮食安全, 因此将其列入
我国的进境植物检疫性有害生物, 快速准确的检疫检测技术能有效阻止其传播, 保证稻谷
安全生产。
[0003]目前对于水稻细菌性谷枯病菌的检测主要是传统的生物测定, 直接分离以及分子
检测的多聚酶链式反应(PCR)方法实时荧光PCR(qRT ‑PCR)方法和血清学方法, 但PCR和
ELISA方法灵敏度有限, 且耗时较长, qRT ‑PCR依赖昂贵的检测仪器并对环境中的抑制因素
和污染较为敏感, 容 易有假阳性或假阴性。
[0004]重组酶聚合酶扩增技术(RPA)技术是2006年提出的一种新型多酶恒温核酸扩增技
术, 可以快速且便捷 地进行核酸检测分析(Piepenburg et al.,2006)。 在2 5‑43℃的恒温条
件下, RPA技术能在5 ‑20min内实现特定核酸序列的扩增并观察到结果。 本实验采用的是改
进的RPA技术称为多酶恒温核酸快速扩增技术(MIRA), 具有更好的稳定性和相同时间更高
的荧光值(Hui Chenet al.,2021)。
发明内容
[0005]本发明的第一目的在于提供一种组合产品, 包 含:
[0006]上游引物: TCGCTCTC CCGAGGGAGATGACAGC CGCTACA;
[0007]下游引物: ACACG GAACACCTGGGTAGTCTCTGTAG GGAAG; 以及
[0008]探针: CCATCTCAAATAAGCGCTTCCGCTATCCACTXTACTACT TCT TCCAGAT;
[0009]其中所述探针为基于重组酶 聚合酶扩增技术的探针, 第3 1位碱基T标记发光基团,
第32位X为脱碱基核苷 酸类似物, 第33位碱基T标记淬灭基团, 3 ’端进行阻断剂修饰; 所述阻
断剂用于阻断探针的聚合酶延伸。
[0010]本发明的第二目的在于提供 试剂盒, 其包 含如上所述的组合产品。
[0011]本发明的第三目的在于提供如上所述的组合产品, 或如上所述的试剂盒在检测水
稻细菌性谷枯病菌中的应用。说 明 书 1/9 页
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专利 用于检测水稻细菌性谷枯病菌的组合产品及试剂盒
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