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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210719618.8 (22)申请日 2022.06.23 (71)申请人 香港中文大 学 (深圳) 地址 518100 广东省深圳市龙岗区龙城街 道龙翔大道 2001号 (72)发明人 刘国珍 龙轶 (74)专利代理 机构 北京鼎德宝 专利代理事务所 (特殊普通 合伙) 11823 专利代理师 王媛 (51)Int.Cl. C12N 15/11(2006.01) C12P 19/34(2006.01) C12Q 1/6806(2018.01) C12Q 1/6844(2018.01) G01N 33/68(2006.01)G01N 33/58(2006.01) (54)发明名称 环状核酸分子、 其制备方法以及 核酸探针和 检测方法 (57)摘要 发明公开了一种环状核酸分子、 其制备方法 以及核酸探针和检测方法, 涉及分子检测技术领 域。 该环状核 酸分子其不含碱基C, 其线性核苷酸 序列为(GGTTATTATT)n, 其中, n≥3。 本发明公开 的环状核酸 分子仅含有三种碱基, 且 具有最少二 级结构的重复序列, 以此序列为模板进行 RCA, 具 有较高的扩增效率和更高的与单链DNA信号探针 结合的效率, 因此检测更高效, 灵敏度更高。 可广 泛适用于信号放大、 纳米结构、 生物传感、 分子诊 疗等领域。 权利要求书2页 说明书9页 序列表1页 附图8页 CN 114854736 A 2022.08.05 CN 114854736 A 1.一种适用于RCA反应作为模板获取长单链核酸分子的环状核酸分子, 其特征在于, 其 不含碱基C, 其线性核苷酸序列为(G GTTATTATT)n, 其中n≥3; n 为整数。 2.根据权利要求1所述的环状核酸分子, 其特 征在于, n =4‑6, 优选地, n =5。 3.根据权利要求1或2所述的环状核酸分子, 其特征在于, 所述环状核酸分子的线性核 苷酸序列如SEQ ID NO.1所示: G GTTATTATTGGTTATTATTGGTTATTATTGGTTATTATTGGTTATTATT。 4.一种用于制备如权利要求1 ‑3任一项所述的环状核酸分子的前体核酸分子, 其特征 在于, 其为直链结构, 其 通过成环反应形成如权利要求1 ‑3任一项所述的环状核酸分子; 优选地, 所述前体核酸分子的核苷酸序列为P ‑(GGTTATTATT)n, 其中n≥3, n为整数, P为 磷酸基团。 5.根据权利要求 4所述的前体核酸分子, 其特 征在于, n =4‑6, 优选地, n =5。 6.如权利要求1 ‑3任一项所述的环状核酸分子的制备方法, 其特征在于, 其包括: 成环 反应步骤, 所述成环反应步骤包括: 将权利要求4或5所述的前体核酸分子置于成环反应体系中进 行反应以获得 所述环状核酸分子 。 7.根据权利要求6所述的制备方法, 其特征在于, 所述成环反应体系含有环化连接酶、 ATP、 氯化锰、 以及缓冲液。 8.根据权利要求6或7所述的制备方法, 其特征在于, 进行环化反应的条件为: 58 ‑62℃ 孵育0.5‑1小时, 80 ‑99℃孵育8‑12分钟。 9.一种进行RCA反应以获取长单链核酸分子的方法, 其特征在于, 其包括: 使用权利要 求1‑3任一项所述的环状核酸分子作为模板进行RCA反应; 优选地, 进行RCA反应所用的引物序列如SEQ ID NO.4所示。 10.由权利要求9的所述的方法得到的长链核酸分子 。 11.一种携带检测信号的核酸探针, 其特 征在于, 其包括: 至少一个主核酸链、 以及至少一个信号核酸链; 其中, 所述主核酸链为权利要求10所述 的长单链核酸分子; 所述信号核酸链与 所述主核酸链直接结合或间接结合, 所述信号核酸链修饰有可被检 测的信号标记 物; 所述主核酸链的端部用于与检测分子结合, 所述检测分子可 特异性结合靶标分子 。 12.根据权利要求11所述的核酸探针, 其特征在于, 所述信号核酸链与 所述主核酸链直 接互补结合; 优选地, 所述信号核酸链来自权利要求10所述的长单链核酸分子 。 13.根据权利要求11所述的核酸探针, 其特征在于, 所述信号核酸链通过至少一个支核 酸链与所述主 核酸链间接结合; 每个所述支核酸链包括: 头部区和尾部区, 所述头部区互补结合至所述主核酸链, 所述 尾部区互补结合至少一个所述信号核酸链。 14.根据权利要求11所述的核酸探针, 其特征在于, 所述信号核酸链通过至少一个第 一 支核酸链和至少一个第二支核酸链与所述主 核酸链间接结合; 每个所述第一支核酸链包括: 与所述主核酸链互补结合的第一头部区, 以及互补结合 至少一个所述第二支核酸链的第一尾部区;权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 114854736 A 2每个所述第 二支核酸链包括: 与 所述第一支核酸链的第 一尾部区互补结合的第 二头部 区, 以及互补结合至少一个所述信号核酸链的第二尾部区。 15.根据权利要求11 ‑14任一项所述的核酸探针, 其特征在于, 所述靶标结合区位于所 述主核酸链的5 ’端。 16.根据权利要求11 ‑14任一项所述的核酸探针, 其特征在于, 所述信号标记物为量子 点。 17.根据权利要求16所述的核酸探针, 其特征在于, 所述量子点选自Q525、 Q565、 Q585、 Q605、 Q625、 6 55、 Q705和Q800; 优选地, 所述靶标分子为蛋白或多肽, 所述检测分子为能特异性结合所述蛋白或所述 多肽的抗体; 优选地, 所述靶标分子为核酸片段, 所述检测分子为能与所述核酸片段互补结合的核 酸片段。 18.一种核酸探针结合物, 其特征在于, 所述核酸结合物包括检测分子、 以及连接在所 述检测分子上的如权利要求11 ‑17任一项所述的核酸探针, 所述检测分子可特异性结合靶 标分子。 19.一种抗体 ‑核酸探针结合物, 其特征在于, 所述抗体 ‑核酸结合物包括抗体、 以及连 接在所述抗体上的如权利要求11 ‑17任一项所述的核酸探针, 所述核酸探针的端部连接至 所述抗体, 所述检测分子为所述 抗体。 20.一种单分子超灵敏度POCT检测蛋白质的方法, 其特征在于, 其包括: 使用如权利要 求11‑17任一项所述的核酸探针, 或如权利要求18所述的核酸探针结合物, 或如权利要求19 所述的抗体 ‑核酸探针结合物进行检测。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 114854736 A 3
专利 环状核酸分子、其制备方法以及核酸探针和检测方法
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