(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210601821.5 (22)申请日 2022.05.30 (71)申请人 深圳华大基因股份有限公司 地址 518083 广东省深圳市 盐田区洪安 三 街21号华大综合园7栋7层-14层 (72)发明人 罗红玉　潘迪　王融　白丹阳　 (74)专利代理 机构 深圳鼎合诚知识产权代理有 限公司 4 4281 专利代理师 周建军　彭家恩 (51)Int.Cl. C12Q 1/6883(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 检测家族性高胆固醇血症及他汀类药物基 因的试剂盒 (57)摘要 一种检测家族性高胆固醇血症及他汀类药 物基因的试剂盒及方法， 试剂盒包括用于扩增 SNP位点的引物， SNP位点位于家族性高胆固醇血 症相关基因、 药物的用药指导基因中的至少一 种； 试剂盒还包括延伸引物， 用于在PCR扩增后的 产物的SNP位点上延伸1个碱基； 家族性高胆固醇 血症相关基因包括LDLR基因、 APOB基因 中的至少 一种； 药物包括他汀类药物； 药物的用药指导基 因包括APOE基因、 SLCO1B1基因中的至少一种。 本 发明开发了针对家族性高胆固醇血症中国人群 中常见的突变热点和他汀类用药指导位点的检 测试剂盒， 可对高危人群进行大规模筛查， 并且 还可以做到筛查和用药零延 迟， 实现早筛早诊早 治。 权利要求书3页 说明书19页 序列表20页 附图2页 CN 114908155 A 2022.08.16 CN 114908155 A 1.一种检测家族性高胆固醇血症及他汀类药物基因的试剂盒， 其特征在于， 所述试剂 盒包括用于扩增所述SNP位点的引物， 所述SNP位点位于家族性高胆固醇血症相关基因、 药 物的用药指导基因中的至少一种； 所述试剂盒还包括延伸引物， 用于在P CR扩增后的产物的 SNP位点上延伸1个碱基； 所述家族性高胆固醇血症相关基因包括 LDLR基因、 APOB基因中的至少一种； 所述药物包括 他汀类药物； 所述药物的用药指导基因包括APOE基因、 SLCO1B1基因中的至少一种。 2.如权利要求1所述的试剂盒， 其特征在于， 位于所述LDLR基因的SNP位点包括如下位 点中的至少一种： c.12G>A c.760C>T c.1216C>A c.1757C>A c.97C>T c.817+1G>A c.1241T>G c.1783C>T c.101G>C c.828C>A c.1268T>C c.1864G>T c.268G>A c.974G>A c.1285G>A c.1879G>A c.310T>C c.986G>A c.1291G>A c.1897C>T c.313+1G>A c.1048C>T c.1322T>C c.1953_1954del c.400T>C c.1132C>T c.1432G>A c.2030G>A c.428G>A c.1174insT c.1448G>A c.2030G>T c.516C>G c.1187‑10G>A c.1469G>A c.2054C>T c.632_634del c.1206delC c.1474G>A c.2054C>G c.665G>T c.1211C>T c.1599G>A c.2344A>T c.682G>A c.1216C>T c.1691A>G c.2389G>A c.682G>T / c.1747C>T c.2439G>A ； 优选地， 位于所述LDLR基因的SNP位点还包括如下位点中的至少一种： c.769C>T、 c.1765G>A； 优选地， 位于所述APOB基因的SNP位 点包括c.10 579C>T； 优选地， 位于所述APOE基因的SNP位点包括如下位点中 的至少一种： c.388T>C、 c.526C> T； 优选地， 位于所述SLCO1B1基因的SNP位点包括如下位点中的至少一种： c.388A>G、 c.521T>C 。 3.如权利要求1所述的试剂盒， 其特征在于， 所述SNP位点用于对来自受试者的样本进 行基因分型； 优选地， 所述样本包括含人类 基因组的样本； 优选地， 所述样本包括全血样本、 口腔拭子样本、 唾液样本、 干血片样本； 优选地， 所述试剂盒用于诊断疾病和/或指导用药； 优选地， 所述疾病包括家族性高胆固醇血症、 高血脂症中的至少一种。 4.如权利要求1所述的试剂盒， 其特征在于， 所述用于扩增所述SNP位点的引物包括第 一扩增引物、 第二扩增引物中的至少一种， 所述第一扩增引物包括如SEQ  ID No.1～15、 SEQ   ID No.18～32所示引物中的至少一种；权　利　要　求　书 1/3 页 2 CN 114908155 A 2所述第二扩增引物包括如SEQ  ID No.63～102所示引物中的至少一种； 优选地， 所述第一扩增引物还 包括如SEQ  ID No.16、 17、 3 3、 34所示引物中的至少一种； 优选地， 用于扩增所述SNP位点的引物包括所述第一扩增引物、 第二扩增引物中的全 部； 优选地， 所述第一扩增引物、 第二扩增引物用于同一PCR扩增反应 体系； 优选地， 所述第一扩增引物、 第二扩增引物用于不同的PCR扩增反应 体系。 5.如权利要求1所述的试剂盒， 其特征在于， 所述延伸引物包括第一延伸引物、 第二延 伸引物中的至少一种， 所述第一延伸引物包括如SEQ  ID No.37～62所示引物中的至少一 种； 所述第二延伸引物包括如SEQ  ID No.103～128所示引物中的至少一种； 优选地， 所述第一延伸引物还 包括如SEQ  ID No.35、 36所示引物中的至少一种； 优选地， 所述延伸引物包括所述第一延伸引物、 第二延伸引物中的全部； 优选地， 所述第一延伸引物、 第二延伸引物用于同一延伸反应 体系； 优选地， 所述第一延伸引物、 第二延伸引物用于不同的延伸反应 体系。 6.一种检测家族性高胆固醇血症及他汀类药物基因的方法， 其特 征在于， 包括： 扩增步骤， 包括对待测样本中的SNP位 点进行PCR扩增， 获得扩增产物； 单碱基延伸步骤， 包括对所述扩增产物进行 单碱基延伸， 获得延伸产物； 检测步骤， 包括对所述延伸产物进行质谱检测， 获得 所述SNP位 点的基因型； 所述SNP位 点位于家族性高胆固醇血症相关基因、 药物的用药指导基因中的至少一种； 所述家族性高胆固醇血症相关基因包括 LDLR基因、 APOB基因中的至少一种； 所述药物包括 他汀类药物； 所述药物的用药指导基因包括APOE基因、 SLCO1B1基因中的至少一种。 7.如权利要求6所述的方法， 其特征在于， 位于所述LDLR基因的SNP位点包括如下位点 中的至少一种： c.12G>A c.760C>T c.1216C>A c.1757C>A c.97C>T c.817+1G>A c.1241T>G c.1783C>T c.101G>C c.828C>A c.1268T>C c.1864G>T c.268G>A c.974G>A c.1285G>A c.1879G>A c.310T>C c.986G>A c.1291G>A c.1897C>T c.313+1G>A c.1048C>T c.1322T>C c.1953_1954del c.400T>C c.1132C>T c.1432G>A c.2030G>A c.428G>A c.1174insT c.1448G>A c.2030G>T c.516C>G c.1187‑10G>A c.1469G>A c.2054C>T c.632_634del c.1206delC c.1474G>A c.2054C>G c.665G>T c.1211C>T c.1599G>A c.2344A>T c.682G>A c.1216C>T c.1691A>G c.2389G>A c.682G>T / c.1747C>T c.2439G>A ； 优选地， 位于所述LDLR基因的SNP位点还包括如下位点中的至少一种： c.769C>T、权　利　要　求　书 2/3 页 3 CN 114908155 A 3