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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202211007697.6 (22)申请日 2022.08.22 (71)申请人 迈基诺(重庆)基因科技有限责任公 司 地址 400026 重庆市江北区港城东环路6号 1幢1-2、 2-2、 3 -2、 4-2、 5 -2、 6-2 (72)发明人 伍建 徐敏杰 姬晓雯 (74)专利代理 机构 北京星通盈泰知识产权代理 有限公司 1 1952 专利代理师 黄正奇 (51)Int.Cl. C12Q 1/6883(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 检测ATXN10基因ATTCT重复序列动态突变的 引物组、 试剂盒及方法 (57)摘要 本发明涉及分子生物学领域, 具体涉及一种 检测ATXN10基因ATTCT重复序列动态突变的引物 组、 试剂盒及方法, 本发明通过设计特异性的引 物组, 对样本进行PCR扩增, 产生片断长度不等的 PCR产物, 产物的一端包含有FA M荧光, 对PCR产物 进行毛细管电泳, 分析ATTCT的重复数, 且 误差不 超过1次重复; 利用检测ATXN10基因中ATTCT重复 数对SCA10进行评估, 可以快速对脊髓小脑性共 济失调10 型ATXN10基因ATTCT五核苷酸重复数做 出检测、 评估, 检测过程 耗时短, 检测效率高。 权利要求书2页 说明书6页 附图1页 CN 115216537 A 2022.10.21 CN 115216537 A 1.一种检测ATXN10基因ATTCT重复序列动态突变的引物组, 其特征在于, 所述引物组包 括引物SCA10P1、 引物SCA10P2、 引物SCA10P3和引物SCA10P4; 所述引物SCA10P1的5 ’端由荧 光基团标记; 所述引物SCA10P1的核苷酸序列为GA AGACAAATAGAAAACAGATGGCA; 所述引物SCA10P2的核苷酸序列为TACGCATC CCAGTTTGAGACG; 所述引物SCA10P3的核苷酸序列为TACGCATCCCAGTTTGAGACGGAATAGAATAGAATAGAATAGA ATAGAATAGAATAGAATAG; 所述引物SCA10P4的核苷酸序列为GACT TCCCGAAACACCGTC。 2.根据权利要求1所述检测ATXN10基因ATTCT重复序列动态突变的引物组, 其特征在 于, 所述引物SCA10P1的5 ’端带5’ ‑FAM荧光基团。 3.一种检测ATXN10基因ATTCT重复序列动态突变的试剂盒, 其特征在于, 包括权利 要求 1或2所述检测ATXN10基因AT TCT重复序列动态突变的引物组。 4.一种检测ATXN10基因ATTCT重复序列动态突变的非疾病诊断的方法, 其特征在于, 包 括: S1、 提取待测DNA; S2、 利用权利要求1所述的引物组对提取的待测DNA进行PCR扩增; S3、 对所述S2中PCR扩增后的产物进行毛细管电泳; S4、 分析ATXN10基因中的AT TCT重复情况。 5.根据权利要求4所述检测ATXN10基因ATTCT重 复序列动态突变的非疾病诊断的方法, 其特征在于, 所述S2中PCR扩增包括: 按DNA检测样本数量配置扩增反应液混合液, 所述扩增反应液混合液包括: 2 × GoldStar Best Master Mix试剂用量12.5 ×n μl、 浓度为10 μM的SCA 10P1引物用量1 ×n μl、 浓度为10 μM的SCA10P2引物用量1 ×n μl、 浓度为10 μM的SCA10P3引物用量0.1 ×n μl、 浓度为 10 μM的SCA10P4引物用量1 ×n μl、 DMSO用量1 ×n μl和ddH2O用量7.4 ×n μl; 其中n=检测样本 数量+1; 按24 μl扩增反应混合液中加入1 μlDNA; 进行PCR扩增。 6.根据权利要求5所述检测ATXN10基因ATTCT重 复序列动态突变的非疾病诊断的方法, 其特征在于, 所述PCR扩增包括: 在PCR仪中先以95℃变性1分钟; 再运行35次如下循环: 94℃变性30秒、 56℃退火30秒和 72℃延伸1分钟; 最后72℃延伸5分钟, 4℃保存。 7.根据权利要求4所述检测ATXN10基因ATTCT重 复序列动态突变的非疾病诊断的方法, 其特征在于, 所述S3包括: 对PCR扩增后的产物进行稀释, 在d dH2O中加入稀释后的PCR扩增后的产物; 取ABI GS500‑LIZ内标和HIDI按 1∶250的体积比混合得混合液, 取所述混合液与所述稀 释后的PCR扩增后的产物混合制成上机混合液; 将所述上机混合液在PCR仪上以95℃运行3分钟后, 冷却5分钟, 在0℃ ±1℃, 进行变性 处理; 采用G5颜色 分组, 在ABI373 0xl测序仪中进行检测。 8.根据权利要求4所述检测ATXN10基因ATTCT重 复序列动态突变的非疾病诊断的方法, 其特征在于, 所述S4包括:权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 115216537 A 2采用genemarker ID v2.6.3软件对分型结果进行判 读, 核对校正内标峰后, 定义166bp 处为ATTCT1处, 根据每隔5bp出现的荧 光串峰个数计算AT TCT重复数。 9.一种检测ATXN10基因ATTCT重复序列动态突变的系统, 其特征在于, 包括: 待测DNA提 取模块、 PCR扩增扩增模块、 毛细管电泳模块和分析模块; 所述待测DNA提取模块, 用于提取待测DNA; 所述PCR扩增扩增模块, 用于利用权利 要求1所述的引物组对提取的待测 DNA进行PCR扩 增; 所述毛细管电泳模块, 用于对PCR扩增后的产物进行毛细管电泳; 所述分析模块, 用于分析ATXN10基因中的ATTCT重复情况; 若所述ATXN10基因中的 ATTCT重复数为10 ‑32, 则待测DNA的检测结果 为正常。 10.权利要求1或2所述检测ATXN10基因ATTCT重 复序列动态突变的引物组或权利要求3 所述检测ATXN10基因ATTCT重复序列动态 突变的试剂盒在制备脊髓小脑 性共济失调10型病 样诊断剂中的应用。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 115216537 A 3
专利 检测ATXN10基因ATTCT重复序列动态突变的引物组、试剂盒及方法
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