(19)国家知识产权局
(12)发明 专利申请
(10)申请公布号
(43)申请公布日
(21)申请 号 202210677922.0
(22)申请日 2022.06.15
(71)申请人 湖南工程学院
地址 411104 湖南省湘潭市福星东路8 8号
(72)发明人 张何 杨苑 杨梅 张培柔 傅昕
(74)专利代理 机构 长沙伊柏专利代理事务所
(普通合伙) 4326 5
专利代理师 罗莎
(51)Int.Cl.
C12Q 1/689(2018.01)
C12N 15/11(2006.01)
C12Q 1/682(2018.01)
C12R 1/32(2006.01)
(54)发明名称
基于DNAzyme双循环体系的牛结核分枝杆菌
检测探针组及其检测方法
(57)摘要
本发明提供了一种基于DNA zyme双循环体系
的牛结核分枝杆菌检测探针组及其检测方法, 该
检测探针组包括发夹型探针H1、 发夹型探针H2、
信号链S3和Pb2+, 发夹型探针H1和发夹型探针H2
均为茎环结构且均含有8 ‑17DNAzyme碱基序列,
发夹型探针H1环部区中心位置和信号链S3中心
位置均有8 ‑17DNAzyme特异性切割位点; 发夹型
探针H1连接有与牛结核分枝杆菌靶序列互补的
碱基序列和引发链; 发夹型探针H2包含有与引发
链、 信号链S3互补的碱基序列。 本发明检测探针
将Pb2+依赖型8‑17DNAzyme作为双循环信号放大
体系的中心元件, 实现牛结核杆菌检测 信号高效
放大的目的, 同时本方法不依赖胞内酶系, 能够
在体外进行检测筛选, 实现对牛结核分枝杆菌
DNA的快速高灵敏检测。
权利要求书2页 说明书7页
序列表3页 附图5页
CN 115011713 A
2022.09.06
CN 115011713 A
1.一种基于DNAzyme双循环体系的牛结核分枝杆菌检测探针组, 其特征在于, 包括发夹
型探针H1、 发夹型探针H2、 信号链S3和Pb2+;
所述发夹 型探针H1和发夹型探针H2均为茎环结构, 所述发夹型探针H1和发夹型探针H2均
含有8‑17DNAzyme碱基序列, 所述发夹型探针H1环部区中心位置和信号链S3中心位置均有8 ‑
17DNAzyme 特异性切割位 点;
所述发夹型探针H1的茎部区游离3 ’端和环部区分别连接有a1区和b1区, 所述a1区和b1区
分别为与牛结核分枝杆菌靶序列 5’端和3’端互补的碱基序列, 所述发夹型探针H1还包含有
引发链序列;
所述发夹型探针H2的环部区包含有与所述引发链互补的碱基序列, 所述发夹型探针H2
的游离3’端和茎部互补区分别连接有a2区和b2区, 所述a2区和b2区分别为与所述信号链S3的
5’端和3’端互补的碱基序列;
所述信号链S3的两端分别连接有荧 光基团和荧 光淬灭基团。
2.根据权利 要求1所述的基于DNAzyme双循环体系的牛结核分枝杆菌检测探针组, 其特
征在于, 所述a1区基因序列如SEQ ID NO.1所示: GTCTGCACA; 所述b1区基因序列如SEQ ID
NO.2所示: TAGTC CTCT。
3.根据权利 要求1所述的基于DNAzyme双循环体系的牛结核分枝杆菌检测探针组, 其特
征在于, 所述a2区基因序列如SEQ ID NO.3所示: AACTAAGA; 所述b2区基因序列如SEQ ID
NO.4所示: GA ACTATCT。
4.根据权利 要求1所述的基于DNAzyme双循环体系的牛结核分枝杆菌检测探针组, 其特
征在于,
所述发夹型探针H1的基因序列如SEQ ID NO.5所示:
GGATCAAAAATAGTCCTCTACTrAGTCTTTTTTTTTGATCCGAGCCGGACGAAGTGTCTGCACA, 该序列中
rA为RNA碱基, 为特异性切割位 点;
所 述 牛 结 核 分 枝 杆 菌 靶 序 列 的 基 因 序 列 如 S E Q I D N O .8 所 示 :
TGTGCAGACG GAGAGGACTAGAT TTGTCAGA。
5.根据权利 要求1所述的基于DNAzyme双循环体系的牛结核分枝杆菌检测探针组, 其特
征在于, 所述发夹型探针H2的基因序列如SEQ ID NO.6所示: GGAGATAGTTCAGTAGAGGACTATT
TTTGATAAGAACTATCTC CGAGCCGGACGAAACTAAGA;
所述信号链S3的基因序列如SEQ ID NO.7所示: TCTTAGTTrAGGATAGTT, 该序列中rA为RNA
碱基, 为特异性切割位 点。
6.根据权利 要求1所述的基于DNAzyme双循环体系的牛结核分枝杆菌检测探针组, 其特
征在于, 所述 荧光基团为FAM基团, 所述 荧光淬灭基团为BHQ基团。
7.一种如权利 要求1~6任一项所述的基于DNAzyme双循环体系的牛结核分枝杆菌检测
探针组的检测方法, 其特 征在于, 包括以下步骤:
S1、 探针序列预处理: 将探针H1、 H2和信号链S3的冻干粉用缓冲溶液溶解, 然后对探针H1、
H2进行退火以形成茎环结构;
S2、 双循环体系反应: 取步骤S1中的缓冲溶液、 退火后的探针H1、 H2溶液与待检测样品混
合加入EP管中混合均匀, 然后避光加入信号链S3溶液混合反应, 一 步构建双循环反应 体系;
S3、 荧光值测定: 将步骤S2混合反应液在黑暗条件下用荧光计进行检测, 并记录下荧光权 利 要 求 书 1/2 页
2
CN 115011713 A
2值, 通过荧 光值判断待检测物是否含有牛 结核分枝杆菌;
所述缓冲溶 液含有Pb2+。
8.根据权利要求7所述的检测方法, 其特征在于, 所述缓冲液包括Tris ‑HCl、 NaCl和
PbCl2。
9.根据权利 要求7所述的检测方法, 其特征在于, 所述步骤S1中退火温度设置为:95℃,
5min; 85℃,5min; 70℃,15min; 65℃,15min; 50℃,15min; 40℃,15min; 30℃,15min; 25℃,
90min。
10.根据权利要求7所述的检测方法, 其特征在于, 所述步骤S3中荧光计的激发波长为
470nm。权 利 要 求 书 2/2 页
3
CN 115011713 A
3
专利 基于DNAzyme双循环体系的牛结核分枝杆菌检测探针组及其检测方法
文档预览
中文文档
18 页
50 下载
1000 浏览
0 评论
309 收藏
3.0分
温馨提示:本文档共18页,可预览 3 页,如浏览全部内容或当前文档出现乱码,可开通会员下载原始文档
本文档由 人生无常 于 2024-03-18 16:51:20上传分享