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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210632169.3 (22)申请日 2022.06.07 (71)申请人 江苏省家禽科 学研究所 地址 225200 江苏省扬州市邗江区仓颉路 58号 (72)发明人 施寿荣 邵丹 童海兵 胡艳 王强 张珊 肖蕴祺 沈一茹 张安 陈静龙 (74)专利代理 机构 上海智信专利代理有限公司 31002 专利代理师 王洁 郑暄 (51)Int.Cl. C12Q 1/6888(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 与鸡热应激耐受力有关的分子标记、 引物组 合及其检测鉴定方法 (57)摘要 本发明涉及一种与鸡热应激耐受力有关的 SNP分子标记, 所述的SNP分子 标记对应于NCBI上 鸡的参考基因组(Gallus Gallus 5.0)第5号染 色体第40827385位以及40829460位。 其中两个位 点为CC和TT时可作为优势基因型对鸡的热应激 耐受力进行选择, 为鸡分子标记辅助选育热应激 耐受群体提供了一种有效、 简单易操作、 费用低 的分子遗传标记, 为鸡的热应激耐受力改良提供 了一种有效的分子 遗传标记。 权利要求书1页 说明书6页 序列表2页 附图5页 CN 114875160 A 2022.08.09 CN 114875160 A 1.一种与鸡热应激耐受力有关的SNP分子标记, 其特征在于, 所述的SNP分子标记对应 于NCBI上鸡的参考基因组(Gallus Gallus 5.0)第5号染色体第40827385位以及40829460 位。 2.根据权利要求1所述的与鸡热应激耐受力有关的SNP分子标记, 其特征在于, 所述的 第5号染色体第40827385位脱氧核苷酸 为A、 或者是C、 或者是A和C 。 3.根据权利要求1所述的与鸡热应激耐受力有关的SNP分子标记, 其特征在于, 所述的 第5号染色体第4082 9460位脱氧核苷酸是C、 或者是T、 或者是C和T。 4.根据权利要求1所述的与鸡热应激耐受力有关的SNP分子标记, 其特征在于, 所述的 SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示且第16 3为碱基是G或者是A。 5.根据权利要求1所述的与鸡热应激耐受力有关的SNP分子标记, 其特征在于, 所述的 SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示且第40为碱基是G或者是A。 6.根据权利要求1所述的与鸡热应激耐受力有关的SNP分子标记, 其特征在于, 所述的 SNP分子标记用于如下应用: (1)辅助鉴定鸡的热应激耐受能力; (2)选育热应激耐受力相对较高的鸡群 体。 7.一种具有权利要求1~5任一项所述的SNP分子标记的引物 组合, 其特征在于, 所述引 物组合分别由SEQ ID NO.1、 SEQ ID NO.3所示核苷酸序列的上游引物和具有SEQ ID NO.2、 SEQ ID NO.4所示核苷酸序列的下游引物组成。 8.一种检测鉴定耐受热应激的鸡的方法, 其特 征在于, 包括以下步骤: (1)提取一定样本数量的待检测鸡的基因 组DNA; (2)检测所述的基因组DNA中如权利要求1~5任一项所述的SNP分子标记位点的基因 型; (3)基于SNP位点的基因型对鸡高温耐受鸡进行选择, 其中, 选择如权利要求1所述的2 个位点分别为C C和TT基因型的鸡, 其 他基因型的鸡淘汰。 9.根据权利要求8所述的检测鉴定耐受热应激的鸡的方法, 其特征在于, 所述的步骤 (1)中样本数量 为100‑1000只。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 114875160 A 2与鸡热应激耐受力有关的分子标记、 引物组合及其检测鉴定 方法 技术领域 [0001]本发明涉及基 因工程和遗传育种领域, 具体涉及 一种与鸡热应激耐受力有关的分 子标记、 引物组合及其检测鉴定方法。 背景技术 [0002]2022年国家重点研发计划将农业生物环境适应性纳入申报指南, 以响应国家保障 人民粮食安全的举措。 禽产品作为人民粮食的重要组成部 分, 保障其质量安全至 关重要。 而 家禽养殖系统受多种的气候因素影响, 但是 由于当今公众 的认知和丰富的科学信息摄入, 与热应激相关的禽产品质量安全问题变得尤为突出。 在现代集约化家禽养殖 的环境下, 热 应激压力 在家禽生产中受到特别的关注, 它已成为影响家禽生产性能的最关键的环境因素 之一, 包括造成家禽免疫力下降、 生长速度减慢、 饲料转化率低、 禽产品质量变差等不利影 响, 对家禽生产造成了巨大的经济损失, 每年高达1.28 ‑1.65亿美元。 现代商业化家禽由于 其快速的新陈代谢而易产生更多的热量, 使得家 禽对环境 温度更为敏感。 因此, 迫切需要制 定各种有效的缓解策略, 减少相应的生产损失。 一般生产中重点针对环境改善或通过营养 策略来调整改善热应激时的不良影响, 但这不能满足应激条件下家 禽的特殊需要且缓解效 果有限。 因此, 迫切需要开 发有效遗传标记等有效策略, 对家 禽进行耐热能力的选育才是有 效之计。 [0003]目前国内外关于鸡热应激耐受力的分子标记研究尚少, 仅有少数研究报道了可作 为鸡抗热应激的潜在遗传标记。 在当今平衡育种理念下, 提高鸡热应激的耐受力对于适应 未来全球气候变化形势至 关重要。 因此, 精 准定位与鸡热应激耐受相关的数量性状SNP位点 和筛选可鉴定其个体耐受力的DNA分子标记, 不仅可以避免鸡遭受热应激时表型观测选择 的繁琐, 更可以提高选择 的准确性和选择 的遗传进展, 对有效筛选鸡热应激耐受的个体和 抗热应激鸡群 体的选育意义重大。 发明内容 [0004]为了有效筛选鸡热应激耐受的个体, 本发明一方面提供了一种与鸡热应激耐受力 有关的SNP分子标记, 所述的SNP分子标记对应于NCBI上鸡的参考基因组(Gallus Gallus 5.0)第5号染色体第40827385位以及4082 9460位。 [0005]较佳地, 所述的第5号染色体第40827385位脱氧核苷酸是A、 或者是C、 或者是A和C 。 [0006]较佳地, 所述的第5号染色体第4082 9460位脱氧核苷酸是C、 或者是T、 或者是C和T。 [0007]较佳地, 所述的SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示且第163为碱基是G 或者是A。 [0008]较佳地, 所述的SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示且第40为碱基是G 或者是A。 [0009]较佳地, 所述的SNP分子标记用于如下应用:说 明 书 1/6 页 3 CN 114875160 A 3
专利 与鸡热应激耐受力有关的分子标记、引物组合及其检测鉴定方法
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