(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210732941.9 (22)申请日 2022.06.27 (71)申请人 中国科学院植物研究所 地址 100039 北京市海淀区香 山南辛村20 号中国科 学院植物研究所 (72)发明人 景海春　李志刚　郝怀庆　 (74)专利代理 机构 北京兆君联合知识产权代理 事务所(普通 合伙) 11333 专利代理师 胡敬红 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12N 15/11(2006.01) A01H 1/04(2006.01) (54)发明名称 与玉米抗 旱相关基因的分子标记及其应用 (57)摘要 本发明涉及一种玉米抗旱相关基因与分子 标记及其应用。 本发明通过GWAS挖掘到与抗旱显 著相关的InDel位点， 进而开发出了分子标记 DT01。 该分子标记在在干旱敏 感材料中扩增产物 第394‑410位置为AAAGACTAAAGTTTCT这16个碱 基， 而在耐旱材料中扩增产物第394位缺失16个 碱基， 而且对干旱胁迫和正常灌溉条件下株高等 表型具有显著影响。 因此， 本发明的提出为筛选 抗旱玉米材 料提供了新的技 术手段。 权利要求书1页 说明书5页 序列表1页 附图2页 CN 115029475 A 2022.09.09 CN 115029475 A 1.一种与玉米抗旱相关基因的分子标记DT01， 所述的分子标记是使用引物对， 以玉米 基因组为模板通过PCR扩增后得到的I nDel位点， 所述的引物对序列如下： SEQ ID NO.1： 5’ ‑TGGTTTGGAGGTTTGTCCCT‑3’， SEQ ID NO.2： 5’ ‑TCCAGCCCGTCGAAATAGAA‑3’。 2.根据权利要求1所述的分子标记DT01， 在干旱敏感材料中扩增产物第394 ‑410位置为 AAAGACTAAAGTTTCT这16个碱基， 而在耐旱材 料中扩增产物从第394 位起缺失这16个碱基。 3.根据权利要求1所述的分子标记DT01， 所述相关基因位于玉米第2号染色体上。 4.扩增与玉米抗 旱相关基因的分子标记DT01的引物对， 其中 正向引物序列为SEQ  ID NO.1： 5’ ‑TGGTTTGGAGGTTTGTCCCT‑3’， 反向引物序列为SEQ  ID NO.2： 5’ ‑TCCAGCCCGTCGAAATAGAA‑3’。 5.与玉米抗 旱相关基因的分子标记DT01在种质资源的筛 选或鉴定中的应用。 6.根据权利要求5所述的应用， 为使用引物对， 以玉米基因组为模板通过PCR扩增后得 到的InDel位点， 在扩增产 物中， 耐旱材料基因型缺失16bp， 干旱敏感材料基因型与B73参考 基因组序列相同， 在第394 ‑410位置含有AAAGACTAAAGTTTCT这16个碱基， 所述的引物对序列 如下： SEQ ID NO.1： 5’ ‑TGGTTTGGAGGTTTGTCCCT‑3’， SEQ ID NO.2： 5’ ‑TCCAGCCCGTCGAAATAGAA‑3’。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 115029475 A 2与玉米抗旱相关基因的分子标记及其应用 技术领域 [0001]本发明涉及 一个玉米抗旱相关基因的分子标记及 其应用， 属于玉米育种和分子生 物学领域。 背景技术 [0002]随着全球气候变化， 农业生产所面临的非物胁迫也越来严峻， 例如高低温、 干旱、 盐碱等。 在非生物胁迫中， 干旱是影响植物生长发育和作 物产量的主要因素之一， 在过去的 十年间， 全球因干旱造成的粮食损失达300亿美元(Gupta  A,Rico‑Medina A,Cao‑Delgado  AI.The physiology  of plant responses  to drought[J].Science,2020,368:266 ‑269)。 我国每年干旱造成的粮食损失约占各种自然灾害总量的60％。 玉米是典型的旱地农作物， 整个生育期需水量大， 对干旱胁迫极为敏感， 任何阶段遭受干旱 都会造成减产， 尤其是开花 期和灌浆期(Liu  S,Qin F.Genetic  dissection  of maize drought tolerance  for  trait improvement[J].Molecular  Breeding,2021,41:8； Lobell  DB,Roberts  MJ, Schlenker  W,et al.Greater  sensitivity  to drought accompanies  maize yield  increase  in the US midwest[J].Science,2014,344:516 ‑519； Boyer  JS,Westgate   ME.Grain  yields with limited water[J].Journal  of Experimental  Botany,2004,55: 2385‑2394)。 因此， 亟需培育抗旱玉米新品种应对全球气候变化， 保护人类粮食安全。 利用 生物技术挖掘玉米生殖生长阶段抗旱相关基因， 将为玉米新品种培育提供宝贵的遗传信 息， 推动耐旱玉米新品种培 育的进程。 发明内容 [0003]本发明的目的之一是提供一个与玉米抗旱相关的基因ZmDTIv2的分子标记， 为以 玉米基因组为模板通过PCR扩增后得到的InDel位点， 耐旱材料基因型为缺失16bp， 干旱敏 感材料基因型与B73参 考基因组序列相同， 含有A AAGACTAAAGTTTCT这16个碱基。 [0004]本发明的目的之二是提供一种与玉米抗旱相关基因的分子标记的应用， 可以用于 鉴定、 筛选玉米优良品种。 [0005]为了达到上述目的， 本发明采用了以下技 术手段： [0006]一种与玉米抗旱相关基因的分子标记DT01， 所述的分子标记是使用引物对， 以玉 米基因组为模板通过PCR扩增后得到的I nDel位点， 所述的引物对序列如下： [0007]SEQ ID NO.1： 5’ ‑TGGTTTGGAGGTTTGTCCCT‑3’， [0008]SEQ ID NO.2： 5’ ‑TCCAGCCCGTCGAAATAGAA‑3’。 [0009]在干旱敏感材料中扩增产物第394 ‑410位置为AAAGACTAAAGTTTCT这16个碱基， 而 在耐旱材 料中扩增产物从第394 位起缺失这16个碱基。 [0010]所述相关基因位于玉米第2号染色体上。 [0011]扩增与玉米抗 旱相关基因的分子标记DT01的引物对， 其中 [0012]正向引物序列为SEQ  ID NO.1： 5’ ‑TGGTTTGGAGGTTTGTCCCT‑3’，说　明　书 1/5 页 3 CN 115029475 A 3