(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210692368.3 (22)申请日 2022.06.17 (71)申请人 中国农业科 学院作物科 学研究所 地址 100081 北京市海淀区中关村南大街 12号 (72)发明人 邱丽娟　李英慧　李德林　白东　 (74)专利代理 机构 北京路浩知识产权代理有限 公司 11002 专利代理师 刘璞 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 与大豆冠层覆盖度和开花期相关联的SNP分 子标记与应用 (57)摘要 本发明涉及生物 技术领域， 尤其涉及与大豆 冠层覆盖度和开花期相关联的SNP分子标记与应 用。 本发明提供一种 与大豆冠层覆盖度和开花期 相关联的SNP分子标记， 所述SNP分子标记含有如 SEQ ID NO.1所示序列第342位的多态性为T和C 的核苷酸序列。 本发明发现的SNP分子标记对于 大豆在分子鉴定和辅助育种方面， 具有非常重要 的指导意义。 权利要求书1页 说明书24页 序列表2页 CN 115141895 A 2022.10.04 CN 115141895 A 1.一种与大豆冠层覆盖度和开花期相 关联的SNP分子标记， 其特征在于， 所述SNP分子 标记含有如SEQ  ID NO.1所示序列第342位的多态性 为T和C的核苷酸序列。 2.根据权利要求1所述与大豆冠层覆盖度和开花期相关联的SNP分子标记， 其特征在 于， 具有所述多态性的位点的基因型为TT， 对应于相对冠层覆盖度低且开花期早的表型； 具 有所述多态性的位 点的基因型为C C， 对应于相对冠层覆盖度高且开 花期晚的表型。 3.一种用于扩增如权利要求1或2所述的SNP分子标记的引物。 4.一种试剂盒， 其特 征在于， 所述试剂盒包括权利要求3所述的引物。 5.权利要求1或2所述的SNP分子标记、 权利要求3所述引物、 权利 要求4所述试剂盒在鉴 定大豆冠层覆盖度表型中的应用。 6.权利要求1或2所述的SNP分子标记、 权利要求3所述引物、 权利 要求4所述试剂盒在鉴 定大豆开 花期表型中的应用。 7.权利要求1或2所述的SNP分子标记、 权利要求3所述引物、 权利 要求4所述试剂盒在大 豆种质资源鉴定、 改良或定向育种中的应用。 8.权利要求1或2所述的SNP分子标记、 权利要求3所述引物、 权利 要求4所述试剂盒在大 豆分子标记辅助育种 、 全基因组选择育种中的应用。 9.权利要求1或2所述的SNP分子标记、 权利要求3所述引物、 权利 要求4所述试剂盒在筛 选和/或培 育冠层覆盖度高且开 花晚的大豆中的应用。 10.一种鉴定大豆冠层覆盖度和/或开花期表型的方法， 其特征在于， 所述方法包括如 下步骤： 1)在待测样品中检测权利要求1所述的SNP分子标记的多态性 位点的基因型； 2)依据步骤1)所 得到的基因型判断待测样品的冠层覆盖度和开 花期； 具体判断方法为： 若所得到的基因型为TT， 则所述待测大豆为候选的相对冠层覆盖度 低且开花期早的大豆； 若所得到的基因型为CC， 则所述待测大豆为候选的相对冠层覆盖度 高且开花期晚的大豆 。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 115141895 A 2与大豆冠层覆盖度和开花期相关联的SNP分子标记与应用 技术领域 [0001]本发明涉及生物技术领域， 尤其涉及一种与大豆冠层覆盖度和开花期相关联的 SNP分子标记与应用。 背景技术 [0002]大豆是世界范围重要的粮油兼用作物， 是人类优质蛋白及饲用蛋白的主要来源。 冠层覆盖度的时序性遗传解析可以为大豆理想株型奠定基础。 “高产理想型 ”大豆叶面积需 要前期扩展快， 达峰值短， 后期下降缓慢(盖钧镒等， 1990)， 即冠层的 “早封垄、 晚衰老 ”。 此 外作为短日作物， 大豆需要严格的光周期条件， 存在大豆品种适应范围狭窄， 区域性 强等特 点， 限制了大豆品种的引进、 培育和大范围种植推广。 对全生育期时序性冠层覆盖度和开花 期的遗传解析有望为理想株型和广适 性高产大豆的选 育提供理论依据。 [0003]限于人工表型鉴定 的低效性， 时序性冠层覆盖度的遗传解析研究少有报道。 近年 来， 随着无人机田间表型平台的成熟， 在时序性大豆冠层覆盖度 的研究方面获得了进展。 Xavier等(2017)利用此技术挖掘到了19个冠层覆盖度QTLs。 相比之下， 大豆花期和生育期 相关的基因位点在大豆中研究较为深入， 主要有12个基因被功能性验证， 分别是E1和E2 (Bernard， 1971)、 E3(Buzzell， 1971)、 E4(Buzzell和Volden， 1980)、 E5(Dissanayaka  et  al.， 2016)、 E6(Bonato和Vello， 1999)、 E7(Cober和Voldeng， 2001)、 E8(Cober  et al.， 2010)、 E9(Kong  et al.， 2014)、 J(Ray  et al.， 1995)、 PRR3b(Li  et al.， 2020)和PRR3a(Lu   et al.， 2020)等。 [0004]随着重要产量性状QTL的连锁或关联分子标记的开发和使用， 分子标记辅助选择 成为了快速育种中的重要手段之一(Cregan  et al.,1999)。 分子标记辅助选择的最大优点 是在不需要评估表型特征的情况下， 通过确认是否带有目标基因型而鉴定出目标表型的植 株。 [0005]若能证明一个同时与大豆冠层覆盖度和开花期相关联的SNP位点， 可为大豆在分 子鉴定和辅助育种等方面 提供有力的技 术支持。 发明内容 [0006]本发明提供与大豆冠层覆盖度和开花期相关联的SNP分子标记与应用， 可实现快 速检测大豆冠层覆盖度和开花期， 为大豆在分子鉴定和辅助育种等方面提供有力的技术支 持。 [0007]本发明提供一种与大豆冠层覆盖度和开花期相关联的S NP分子标记， 所述S NP分子 标记含有如SEQ  ID NO.1所示序列第342位的多态性 为T和C的核苷酸序列。 [0008]根据本发明提供的一种与大豆冠层覆盖度和开花期相关联的SNP分子标记， 具有 所述多态性的位点的基因型为TT， 对应于相对冠层覆盖度低且开花期早的表型； 具有所述 多态性的位 点的基因型为C C， 对应于相对冠层覆盖度高且开 花期晚的表型。 [0009]本发明提供一种用于扩增上述SNP分子标记的引物。说　明　书 1/24 页 3 CN 115141895 A 3