(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210593468.0 (22)申请日 2022.05.27 (71)申请人 西南大学 地址 400715 重庆市北碚区天生路2号 (72)发明人 吴致君　罗理勇　曾亮　 (74)专利代理 机构 北京同恒源知识产权代理有 限公司 1 1275 专利代理师 廖曦 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一组鉴定重庆大茶树群体种质SNP标记、 引 物组及其应用 (57)摘要 本发明提供了一组鉴定重庆大茶树群体种 质的SNP标记， 所述群体种质SNP标记包括： 茶树 Chr8染色体第119192825位位点为序列表中SEQ   I D No.1的第301位核苷酸， 和/或茶树Chr15染 色体第40853615位位点为序列表中SEQ  I D  No.2的第301位核苷酸。 利用本发明的分子标记 及特异性扩增引物， 可准确地鉴定茶树种质是否 来源于重庆大茶树群体种质， 可用于重庆大茶树 群体种质溯源性 鉴定与保护。 权利要求书1页 说明书5页 序列表2页 附图1页 CN 114891917 A 2022.08.12 CN 114891917 A 1.一组鉴定重庆大茶树群体种质SNP标记， 其特征在于， 所述群体种质SNP标记包括： 茶 树Chr8染色体第119192825位位点为序列表中SEQ  ID No.1的第301位核苷酸， 和/或茶树 Chr15染色体第4085 3615位位点为序列表中SEQ  ID No.2的第3 01位核苷酸。 2.用于扩增权利要求1所述的鉴定重庆大茶树群体种质SNP标记的引物组， 其特征在 于： 所述茶树Chr8染色体第119192825位位点通过引物组1核苷酸序列如SEQ  ID No.3～5所 示扩增鉴定 。 3.用于扩增权利要求1所述的鉴定重庆大茶树群体种质SNP标记的引物组， 其特征在 于： 所述茶树Chr15染色体第40853615位位点通过引物组2核苷酸序列如SEQ  ID No.6～8所 示扩增鉴定 。 4.权利要求1所述的SNP标记在鉴定茶树种质是否来源于重庆大茶树群体种质中的应 用。 5.根据权利要求4所述SNP标记在鉴定重庆大茶树群体种质中的应用， 其特征在于， 包 括以下步骤： 1)提取茶树材 料的DNA； 2)以提取的DNA为模版， 利用权利要求2所述的引物组进行PCR扩增反应； 3)获取荧光信号进行基因分型， 当茶树Chr8染色体第119192825位位点荧光信号基因 分型为CC时是重庆大茶树群 体种质来源， T T时为其他来源茶树种质。 6.根据权利要求4所述SNP标记在鉴定重庆大茶树群体种质中的应用， 其特征在于， 包 括以下步骤： 1)提取茶树材 料的DNA； 2)以提取的DNA为模版， 利用权利要求3所述的引物组进行PCR扩增反应； 3)获取荧光信号进行基因分型， 当茶树材料Chr15染色体第40853615位位点荧光信号 基因分型为T T时是重庆大茶树群 体种质来源， C C时为其他来源茶树种质。 7.根据权利要求4所述SNP标记在鉴定重庆大茶树群体种质中的应用， 其特征在于， 包 括以下步骤： 1)提取茶树材 料的DNA； 2)以提取的DNA为模版， 利用权利要求2和权利要求3所述的引物组进行PCR扩增反应； 3)获取荧光信号进行基因分型， 当茶树Chr8染色体第119192825位位点荧光信号基因 分型为CC时是重庆大茶树群体种质来源， TT时为其他来源茶树种质； 并且当茶树材料Chr15 染色体第408 53615位位点荧光信号基因分型为TT时是重庆大茶树群体种质来源， CC时为其 他来源茶树种质。 8.根据权利要求5、 6、 7所述SNP标记在鉴定重庆大茶树群体种质中的应用， 其特征在 于， 所述步骤2)中PCR的总 反应体积为10μL， 包括2.5μL  DNA、 5μL GUDE FLu‑Arms 2x PCR  Mix、 0.5 μL混合引物和2 μL水。 9.根据权利要求5、 6、 7所述SNP标记在鉴定重庆大茶树群体种质中的应用， 其特征在 于， 所述步骤2)PCR扩增反应条件如下： 95℃10min； 95℃20s， 61 ‑55℃1min  10个循环； 95℃ 20s， 55℃1min， 28‑45个循环； 25℃3 0s。 10.根据权利要求5、 6、 7所述SNP标记在鉴定重庆大茶树群体种质中的应用， 其特征在 于， 所述步骤2)PCR扩增反应在CF X ConnectTM Real‑Time System仪器上进行。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114891917 A 2一组鉴定重庆大茶树 群体种质SNP标记、 引物组及其应用 技术领域 [0001]本发明涉及生物分子标记技术领域， 尤其涉及一组鉴定重庆大茶树群体种质SNP 标记、 引物组及应用。 技术背景 [0002]茶树物种在分类学上是指山茶科(Theaceae)山茶属(Genus  Camellia  Linn.)中 茶组(Sec.Thea(L.)Dyer)植物。 茶树是世界上广泛种植的重要经济作物之一， 是茶饮和 食 用应用领域原料 的重要来源。 然而， 生产上茶树依然存在种植种类单一、 产品同质化严重、 地方特色种质 利用率低等问题。 特色地方茶树种质资源的有效鉴定、 挖掘与利用是解决茶 树种植生产端问题的重要途径。 [0003]重庆大茶树群体种分布于云贵高原向北延伸末端， 主要包括南川、 綦江、 江津等地 方山区。 重庆大茶树种群遗传多样性丰富， 已发现有高多酚、 甜香、 抗寒、 芽叶肥硕、 紫芽等 特异性或连续 性变异性状， 是一类具有经济价 值和开发潜力的种质种群。 [0004]目前， 重庆大茶树群体种质产业化利用快速发展， 应用主要集中在重庆市南川区， 种植的“南川大茶树 ”面积超过1万亩， 发展的 “南川大树茶 ”获得重庆市茶叶三大品牌称号。 然而， 重庆大茶树群体种质种苗推广及产品市场开发进一步良性 发展尚面临真伪鉴定检测 技术缺乏的问题。 发明内容 [0005]有鉴于此， 本发明的目的在于提供一组鉴定重庆大茶树群体种质SNP标记、 引物组 及应用， 采用本发明提供的这组茶树群体种质SNP标记 能够鉴定茶树种质是否来源于重庆 大茶树群 体种质。 [0006]本发明提供的一组鉴定重庆大茶树群体种质SNP标记， 所述群体种质SNP标记包 括： 茶树Chr8染色体第119192825位位点为序列表中SEQ  ID No.1的第301位核苷酸， 和/或 茶树Chr15染色体第4085 3615位位点为序列表中SEQ  ID No.2的第3 01位核苷酸。 [0007]本发明还提供用于扩增上述鉴定重庆大茶树群体种质SNP标记的引物组， 所述茶 树Chr8染色体第119192825位位点通过引物组1核苷酸序列如SEQ  ID No.3～5所示扩增鉴 定。 [0008]所述茶树Chr15染色体第40853615位位点通过引物组2核苷酸序列如SEQ  ID No.6 ～8所示扩增鉴定 。 [0009]本发明还提供上述SNP标记在鉴定茶树种质是否来源于重庆大茶树群体种质中的 应用。 [0010]进一步， 上述SNP标记在鉴定 重庆大茶树群 体种质中的应用， 包括以下步骤： [0011]1)提取茶树材 料的DNA； [0012]2)以提取的DNA为模版， 利用权利要求2所述的引物组进行PCR扩增反应； [0013]3)获取荧光信号进行基因分型， 当茶树Chr8染色体第 119192825位位点荧光信号说　明　书 1/5 页 3 CN 114891917 A 3