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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202211091968.0 (22)申请日 2022.09.07 (71)申请人 辽宁省农业发展服 务中心 地址 110032 辽宁省沈阳市皇姑区辽河街 60号 (72)发明人 杨作丰 周晨阳 魏澍 刘金玲  佟玉红 董娜 刘俊 李英  (74)专利代理 机构 安徽善安知识产权代理事务 所(特殊普通 合伙) 3420 0 专利代理师 石家惠 (51)Int.Cl. C12Q 1/70(2006.01) C12Q 1/6844(2018.01) C12N 15/11(2006.01) C12R 1/93(2006.01) (54)发明名称 一种非洲猪瘟病毒实时荧光环介导等温扩 增检测系统 (57)摘要 本发明公开了一种非洲猪瘟病毒实时荧光 环介导等 温扩增检测系统, 通过反应体系构建模 块在制得混合反应试剂和DNA聚合酶溶液后, 将 混合反应试剂、 DNA聚合酶和扩增模板加入同一 PCR管中混匀构建出含有多混合物的反应体系, 并分别以阳性对照模板和超纯水为阳性和阴性 对照, 通过荧光值对组织样品的检测结果进行判 定, 并通过所述检测方法验证与分析模块验证该 检测系统对非洲猪瘟病毒检测的特异性和灵敏 度。 本检测系统与常规的PCR检测系统相比较, 其 LAMP引物针对模板的六个区段, 对于非洲猪瘟病 毒检测的特异性更高, 检测结果不易出现假阳 性, 其扩增过程无需变性与退火, 反应时间大大 缩短, 适宜高通量大规模筛查, 且可以减少人工 操作。 权利要求书3页 说明书7页 附图1页 CN 115247220 A 2022.10.28 CN 115247220 A 1.一种非洲猪瘟病毒实时荧光环介导等温扩增检测系统, 包括LAMP引物的建立与筛选 模块、 组织样品病毒DNA提取模块、 阳性质粒构建模块、 反应体系构建模块和 检测方法验证 与分析模块, 其特 征在于: 所述LAMP引物的建立与筛选模块用于根据非洲 猪瘟病毒B646L基因的保守结构域设计 三对引物, 其中包括一对内引物FIP和BIP、 一对外引物F3与B3和一对环引物LF和LB, 其引物 序列分别为: FIP: 5 ′ ‑TAACGCCACTATGCAGC CCACGGAAGAGCTGA ATCTCTATC CT‑3′; BIP: 5′ ‑CAACATGTGCGA ACTTGTGCCACATACCTGGAACGTCTCC‑3′; F3: 5′ ‑ATAGGTAATGCGATCG GATACA‑3′; B3: 5′ ‑CCAACAATAACCGCCACGC‑3′; LF: 5′ ‑TCGCCACGCAAAGATAAGC‑3′; LB: 5′ ‑AGCCTCGGTGTTGATGCGGATT‑3′; 所述组织样品病毒DNA提取模块用于获取LAMP检测所需的扩增模板; 所述阳性质粒构建模块以非洲猪瘟病毒B646L基因为模板, 用特异性引物进行PCR反 应, 将目的片段回收后与pMD18 ‑T载体进行连接, 转化DH ‑5α 感受态细胞后挑菌培养, 然后使 用PCR及LAMP方法验证克隆, 制得 阳性对照模板; 所述反应 体系构建模块用于混合反应试剂和DNA聚合酶的制备; 所述检测方法验证与分析模块用于特异性、 灵敏度的验证评估以及临床样品的检测实 用性评价; 所述反应体系构建模块在制得混合反应试剂和DNA聚合酶溶液后, 将混合反应试剂、 DNA聚合酶和扩增模板加入同一PCR管中混匀构建出含有多混合物的反应体系, 并用D ‑Ⅰ矿 物油缓慢加入PCR管液面, 将反应混合物置于恒温扩增仪的反应槽中, 于65℃恒温反应 12min, 荧光采集周期为20 s, 并分别以阳性对照模板和超 纯水为阳性和阴性对照, 通过荧光 值对组织样品的检测结果进行判定, 若CT值≤40, 则判定组织样品为非洲猪瘟病毒核酸阳 性; 若CT值>40, 则判定组织样品为 非洲猪瘟病毒核酸阴性, 并通过所述检测方法验证与分 析模块验证该检测系统对非洲猪瘟病毒检测的特异性和灵敏度, 根据出现的S型扩增曲线 的荧光数值对 扩增环境进行优化。 2.根据权利要求1所述的一种非洲猪瘟病毒实时荧光环介导等温扩增检测系统, 其特 征在于: 所述的扩增模板的获取步骤为: 步骤一: 组织病料的采集与前处 理 具体流程为: 采集疑似非洲猪瘟病毒感染猪的肺脏、 肝脏、 肾脏、 脾脏等组织样品, 用无 菌的剪刀和镊子剪取待检样品约10g于组织匀浆器或研钵中充分匀浆 或研磨, 加入0.3 ml~ 0.5ml组织悬液混匀, 60℃, 30min灭活后, 将悬液转入无菌Eppendorf管中, 4℃条件下 5000r/min离心10mi n, 编号备用; 步骤二: 全血及血清样本的采集与前处 理 具体流程为: 使用含有抗凝血剂的无菌管从耳静脉或前腔静脉采集血液3~5ml, 在60 ℃环境下, 经过30min灭活后, 可直接检测; 若检测血清, 可静置全血样本待血清析出后, 直 接吸取至无菌 Eppendorf管中, 在6 0℃环境下, 经 过30min灭活后, 编号备用; 步骤三: 样品DNA的提取 具体流程为: 取10μL前处理过的样本加入无菌1.5ml离心管, 加入10μl样品处理剂, 混权 利 要 求 书 1/3 页 2 CN 115247220 A 2匀, 94℃裂解2mi n, 瞬时离心, 取 上清液, 即可获取到所需的扩增模板 。 3.根据权利要求1所述的一种非洲猪瘟病毒实时荧光环介导等温扩增检测系统, 其特 征在于: 所述的混合反应试剂的配置方法为: 称取2.4g  Tris, 0.37g氯化钾, 0.12g硫酸镁, 100μL吐温 ‑20, 7.029g甜菜碱, 溶于80mL纯化水, 依次加入终浓度为1.4mmol/L的dNTPs溶 液、 0.2 μmmol/L的外引物溶液、 1.6 μmmol/L的内引物溶液、 0.8 μmmol/L的环引物溶液、 LAMP   TaqMan探针, 加入无菌纯化水定容至100mL, 经过0.22 μm过滤器过滤除菌后, 制得混合反应 试剂。 4.根据权利要求1所述的一种非洲猪瘟病毒实时荧光环介导等温扩增检测系统, 其特 征在于: 所述混合反应试剂、 DNA聚合酶、 扩增模板和D ‑Ⅰ矿物油的体积比为2 2:2:1:10 。 5.根据权利要求1所述的一种非洲猪瘟病毒实时荧光环介导等温扩增检测系统, 其特 征在于: 所述的特异性评估方法为: 以猪瘟病毒、 高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒、 猪伪 狂犬病毒、 猪细 小病毒和猪圆环病毒2型五种病原疫苗为特异 性对照, 分别以上述病毒的核 酸为检测模板, 验证该检测方法的特异性。 6.根据权利要求1所述的一种非洲猪瘟病毒实时荧光环介导等温扩增检测系统, 其特 征在于: 所述的灵敏度评估方法为: 用超微量分光光度计测定质粒浓度, 将质粒进 行10倍倍 比稀释, 稀释度从10‑1到10‑5, 浓度分别为 1ng/ μL、 100pg/ μL、 10pg/ μL、 1pg/ μL、 100fg/ μL, 每 个稀释度取2 μL作为模板加入到反应体系构建模块中进行恒温扩增, 并绘制S型扩增曲线, 验证该检测方法的敏感性。 7.根据权利要求1所述的一种非洲猪瘟病毒实时荧光环介导等温扩增检测系统, 其特 征在于: 所述的临床样品的检测实用性评价方法为: 通过上述检测系统对临床的各种待检 测样品进行检测, 验证该检测方法的临床实用性。 8.根据权利要求1所述的一种非洲猪瘟病毒实时荧光环介导等温扩增检测系统, 其特 征在于: 所述特异性引物为F引物和R引物, 其序列号分别为: F: 5 ′ ‑TTAGGTACTGTA ‑ ACGCAGCACAGCT ‑3′和R: 5′ ‑ATGGCATCAGGAG‑GAGCTTTTTG‑3′。 9.根据权利要求1 ‑8任意一项所述的一种非洲猪瘟病 毒实时荧光环介导等温扩增检测 系统, 其特 征在于: 该检测系统的检测步骤如下: 步骤一, 通过所述LAMP引物的建立与筛选模块根据非洲猪瘟病毒B646L基因的保守结 构域设计三对引物, 并将各引物溶解制得引物溶 液; 步骤二, 通过所述组织样品病毒DNA提取模块采集疑似非洲猪瘟病毒感染猪的肺脏、 肝 脏、 肾脏、 脾脏等组织样品, 裂解离心处 理, 取上清液, 制备 所需的扩增模板; 步骤三, 通过所述阳性质粒构建模块, 以非洲猪瘟病毒B646L基因为模板, 用特异性引 物进行PCR反应, 将目的片段回收后与pMD18 ‑T载体进行连接, 转化DH ‑5α 感受态细胞后挑菌 培养, 然后使用PCR及LAMP方法验证克隆, 制得 阳性对照模板; 步骤四: 通过所述反应体系构建模块制备混合反应试剂和DNA聚合酶溶液, 将混合反应 试剂、 DNA聚合酶和扩增模板加入同一PCR管中混匀构建出含有多混合物的反应体系, 并用 D‑Ⅰ矿物油缓慢加入PCR管液面, 将反应混合物置于恒温扩增 仪的反应槽中, 于65℃恒温反 应12min, 荧光采集周期为20 s, 并分别以阳性对照模板和超 纯水为阳性和阴性对照, 通过荧 光值对组织样品的检测结果进行判定; 步骤五: 通过所述检测方法验证与分析模块分别对非洲猪瘟病 毒检测的特异性和灵敏权 利 要 求 书 2/3 页 3 CN 115247220 A 3

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