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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210595862.8 (22)申请日 2022.05.26 (71)申请人 河南农业大 学 地址 450002 河南省郑州市金 水区文化路 95号 (72)发明人 冯建灿 连晓东 高帆 谭彬  郑先波 王小贝 张海朋 程钧  王伟 张郎郎 叶霞 李继东  (74)专利代理 机构 北京华际知识产权代理有限 公司 11676 专利代理师 袁瑞红 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种鉴定桃花型性状的dCAPs分子标记及其 应用 (57)摘要 本发明公开了一种鉴定桃花型性状的dCAPs 分子标记及其应用, 所述花型包括铃型、 蔷薇型, 本发明通过在突变位点附近引入错配碱基而衍 生出dCAPs标记, 该标记具有共显性、 位点特异、 操作简单和成本低等优点, 在品种分类和分子标 记辅助育种中得到了广泛的应用。 开发的dCAPs 标记, 在突变碱基处通过引入错配碱基G, 获得 SalI‑HF限制性内切酶位点, 可对自然群体和杂 交群体不同花型资源进行准确鉴定, 准确率 100%。 通过开发的与花型性状相关的dCAPs标 记, 在表型与基因型验证中一致, 可以作为一个 分子标记, 用于杂种后代分子标记辅助早期选 择, 对初步筛选不同花型桃种质资源 具有重要的 科学意义和经济价 值。 权利要求书1页 说明书7页 序列表2页 附图2页 CN 115141894 A 2022.10.04 CN 115141894 A 1.一种鉴定桃花型性状的dCAPs分子标记, 其特征在于, 扩增所述分子标记的引物对的 上游引物序列如SEQ  ID NO.1所示, 下游引物序列如SEQ  ID NO.2所示, 所述花型包括铃型 和蔷薇型。 2.一种如权利要求1所述的dCAPs分子标记在鉴定或辅助鉴定桃花铃型/蔷薇型性状 中 的应用。 3.一种如权利要求1所述的dCAPs分子标记在桃花铃型/蔷薇型性状分子标记辅助选择 育种方面的应用。 4.一种试剂盒, 其特 征在于, 包 含权利要求1中所述的分子标记的引物对。 5.一种如权利要求 4所述的试剂盒在辅助选择育种方面的应用。 6.一种鉴定桃花型性状的方法, 其特 征在于, 所述方法包括如下步骤: (1)提取待测桃基因 组DNA; (2)以步骤(1)中所提取基因组DNA为模板, 利用权利 要求1所述分子标记的引物对进行 PCR扩增; (3)对步骤(2)中的扩增产物进行酶切处 理, 之后进行电泳检测; (4)根据步骤(3)的电泳条 带结果进行判定, 具体标准 为: 如果酶切产物为长度308bp的特征条带, 该待测桃为蔷薇型, 如果酶切扩增产物为 282bp的特征条带, 该待测桃为纯合铃型, 如果酶切产物为两条长度 分别为308bp、 282bp的 特征条带, 该待测桃为杂合铃型。 7.用于检测dCAPs分子标记是否存在的试剂在桃花型基因定位中的应用, 其特征在于, 扩增所述标记的引物对的上游引物序列如SEQ.ID.NO.1所示, 下游引物序列如SEQ.ID.NO.2 所示。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 115141894 A 2一种鉴定桃花型性状的dCAPs分子标记及其应用 技术领域 [0001]本发明属于生物技术领域, 具体涉及一种鉴定桃花型性状的dCAPs分子标记及其 应用。 背景技术 [0002]桃(Prunus  persica)属于蔷薇科(Rosaceae)李属(Prunus), 不仅果实营养丰富, 还具有重要的观赏价值。 桃花型分为铃形(Non ‑showy)和蔷薇形(Showy), 受一对等位基因 SH/sh控制, 铃形(SH)对蔷薇形(sh)为显性。 位于Chr8上的PpB3 ‑1基因是花型的候选基因, 参与花瓣发育, 促进花 瓣增大, Pp B3‑1启动子区域的SNP与桃的花型性状高度相关。 [0003]马瑞娟等对507个栽培桃资源花型进行调查分析, 发现铃型花资源79个, 占 15.6%, 蔷薇型花资源428个, 占比84.4%, 说明栽培桃品种以蔷薇型花为主。  Chaparro等 通过9个F2分离群体对桃花 型性状的遗传规律进行 分析, F2后代中铃型花与蔷薇型花的分离 比为3∶ 1, 符合孟德尔遗传规律, 为质量性状。 Fan等将该性状作为一个形态学标记锁定在桃 第8号连锁 群上, 位于标记CPPT006与  PacC13之间。 Micheletti等对1580份桃种质资源进行 GWAS分析, 发现位于第  8号连锁群上有18个SNP标记与花型性状紧密相关, 范围为4.3Mb。 随 后Cao 等利用GWAS分析发现位于第8号连锁群13,740,117  bp处存在一个与花型性状关联 度较高的SNP位点。 本团队对 ‘黄水蜜’(sh)和‘中油桃14号 ’(SH)F1杂交群体后代进行GWAS 分析, 发现位于PpB3 ‑1基因启动子区域的一个SNP关联度最高, 并通过测序发现该SNP位点 与花型性状共分离, 且  PpB3‑1(Pp08G015510)基因在不同花型的花瓣中差异表达, 将PpB3 ‑ 1基因确定为桃花型性状候选基因。 [0004]目前, 在公开号为CN  107893125  A的中国发明专利中, 公开了一种用于鉴定桃花 铃型/蔷薇型性状的单核苷酸多态性标记位点, 利用SNP分子标记将桃花铃型/蔷薇型性状 进行区分, 虽然 区分度能够平均达到95.99%, 但是从公开的内容来看, 对有些品种的预测 准确率为90%, 也就是说有可能预测失败, 这样就对于一些难以区分的品种进行细分存在 一定的问题。 同时, CN  107893125  A的中国发明专利中需要进行测序, 且成本较高, 本专利 采用的是dCAPs标记, P CR产物经过酶切 后, 利用聚丙烯 安凝胶电泳就可以进 行检测, 成本较 低。 发明内容 [0005]本发明的目的在 于提供一种鉴定桃花型性状的dCAPs分子标记, 该标记鉴定铃型/ 蔷薇型的准确率 为100%。 [0006]为实现上述目的, 本发明的技 术方案概 述如下: [0007]一种鉴定桃花型性状的dCAPs分子标记, 其特征在于, 扩增所述分子标记的引物对 的上游引物序列如SEQ  ID NO.1所示, 下游引物序列如SEQ  ID NO.2 所示, 所述花型包括铃 型、 蔷薇型。 [0008]上述dCAPs分子标记在鉴定或辅助鉴定桃花铃型/蔷薇型性状以及辅助选择育种说 明 书 1/7 页 3 CN 115141894 A 3

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