(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210716823.9 (22)申请日 2022.06.23 (71)申请人 中国科学院新疆生态与地理研究所 地址 830000 新疆维吾尔自治区乌鲁 木齐 市北京南路818号 (72)发明人 汪沐阳　丁佳佳　梅宇　徐文轩　 杨维康　师玮　 (74)专利代理 机构 北京东方盛凡知识产权代理 事务所(普通 合伙) 11562 专利代理师 陈月霞 (51)Int.Cl. C12Q 1/6888(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种蒙古野驴微卫星分子标记组合及其引 物和应用 (57)摘要 本发明公开了一种蒙古野驴微卫星分子标 记组合及其引物和应用， 涉及DNA分子标记技术 领域。 该蒙古野驴微卫星分子标记组合， 包括核 苷酸序列分别如SEQ  ID NO .17‑24所示的 Eqr3400、 Eqr5948、 Eqr732、 Eqr166、 Eqr1096、 Eqr1226、 Eqr652和Eqr821。 该分子 标记组合的扩 增引物组合， 包括如SEQ  ID NO.1‑16所示的核苷 酸序列。 本发 明开发了一组具有丰富多态性的蒙 古野驴微卫星分子标记， 并提供了一组蒙古野驴 微卫星引物。 本发明提供的蒙古野驴微卫星引物 对能够对微卫星位点进行特异性扩增， 并且具有 高度多态性。 权利要求书1页 说明书6页 序列表5页 附图32页 CN 114836549 A 2022.08.02 CN 114836549 A 1.一种蒙古野驴微卫星分子标记组合， 其特征在于， 包括核苷酸序列分别如SEQ  ID  NO.17‑24所示的Eqr340 0、 Eqr5948、 Eqr732、 Eqr16 6、 Eqr1096、 Eqr12 26、 Eqr652和Eqr821。 2.一种如权利 要求1所述的分子标记组合的扩增引物组合， 其特征在于， 包括如SEQ  ID  NO.1‑16所示的核苷酸序列。 3.一种如权利要求1所述的分子标记组合或权利要求2所述的扩增引物组合在蒙古野 驴或蒙古野驴的近缘种群遗传结构和遗传多样性研究中的应用。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114836549 A 2一种蒙古野驴微卫星分子标记组合及其引物和应用 技术领域 [0001]本发明涉及DNA分子标记技术领域， 特别是涉及一种蒙古野驴微卫星分子标记组 合及其引物和应用。 背景技术 [0002]微卫星： 微卫星(simple  sequence repeat， SSR)指DNA简单串 联重复序列， 由核心 序列与两侧的侧翼序列构成。 核心序列为 1‑6个核苷酸重复单位， 不同等位基因间的重复数 和重复单元 的差异使其具有长度多态性， 核心序列两侧则由保守的侧翼序列 组成， 在物种 间具有较高的同源性， 因此可用于引物设计。 与其他分子标记相比， 微卫星具有数量多、 稳 定性好、 多态性信息丰富， 共显性和易于检测等优势。 同时， 以PCR技术为基础 的微卫星分 析， 对模板DNA的要求较低， 纳克量 或部分断裂的DNA都能够 有效分析， 因此微卫星 标记被越 来越多的应用于濒危物种的遗传学研究， 例如解释濒危物种的进化历史、 种群遗传结构分 析、 辅助种群调查、 亲缘关系鉴定和近缘物种及杂交个体鉴别等保护生物学重点工作。 然 而， 虽然有研究发现微卫星DNA侧翼序列在近缘物种间具有一定的保守性， 但对一些珍稀濒 危物种， 当缺 乏相关近缘物种微卫星序列信息参考的情况下﹐则需要进行微卫星位点的筛 选和特异引物的开发， 并且濒危物种的遗传多样性普遍较低， 因此开发多态性的微卫星位 点显得更困难也更重要。 [0003]蒙古野驴： 蒙古野驴(Mongolian  WildAss  or Khulan， Equus  hemionus   hemionus)属奇蹄目(Perissodactyla)马 科(Equidae)马属， 是中国国家一级保护动物， 主 要分布于蒙古国南部和中国北部中蒙边境附近地区， 一般以集群活动， 为 目前野生数量最 大的亚种种群。 新疆卡拉麦里保护区分布有中国最大 的蒙古野驴种群， 是保护中国蒙古野 驴的最关键区域， 经过30余年的保护与调查， 该保护区内蒙古野驴的数量不断增长。 然而， 由于农业用地、 过度放牧和经济开 发， 蒙古野驴的栖息地逐渐破碎和边缘化， 导致蒙古野驴 的生存仍然受到威胁， 处于濒 危状态。 目前， 国内对于蒙古野驴的研究主要集中于生态种群 结构、 行为机制以及栖息地等方面， 对其分子遗传学的相关研究极少。 了解物种的遗传背 景 能够帮助保护生物学家更全面地制 定出科学合理的保护对策。 因此， 开发高效有力的分子 标记， 继而能够从分子 遗传学角度对蒙古野驴进行保护， 补足其遗传学研究的短板 。 发明内容 [0004]本发明的目的是提供一种蒙古野驴微卫星分子标记组合及其引物和应用， 以解决 上述现有技术存在的问题， 本发明提供的蒙古野驴微卫星引物对能够 对微卫星位点进 行特 异性扩增， 并且具有高度多态性。 [0005]为实现上述目的， 本发明提供了如下 方案： [0006]本发明提供一种蒙古野驴微卫星分子标记组合， 包括核苷酸序列分别如SEQ  ID  NO.17‑24所示的Eqr340 0、 Eqr5948、 Eqr732、 Eqr16 6、 Eqr1096、 Eqr12 26、 Eqr652和Eqr821。 [0007]本发明还提供一种上述的分子标记组合的扩增引物组合， 包括如SEQ  ID NO.1‑16说　明　书 1/6 页 3 CN 114836549 A 3