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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210654426.3 (22)申请日 2022.06.10 (71)申请人 青海省农林科 学院 地址 810016 青海省西宁市宁大路25 3号 (72)发明人 张得芳 夏涛 王占林 (74)专利代理 机构 北京纪凯知识产权代理有限 公司 11245 专利代理师 张立娜 (51)Int.Cl. C12N 15/11(2006.01) C12Q 1/6895(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01) (54)发明名称 一种花叶海棠S SR标记的开发和应用 (57)摘要 本发明公开了一种花叶海棠SSR标记的开发 和应用。 本发明提供了用于检测花叶海棠的SSR 引物组合由18个引物对中的全部或部分组成, 所 述部分为2个以上17个以下。 18个引物对是从根 据花叶海棠转录组测序数据设计的10 730组引物 中筛选出来的。 实验证明本发明由这18个引物对 组成的SSR引物组合能有效的对花叶海棠群体进 行遗传多样性分析。 本发明对于构建花叶海棠遗 传图谱和种质鉴定具有重要意 义。 权利要求书2页 说明书9页 序列表6页 附图2页 CN 114836417 A 2022.08.02 CN 114836417 A 1.用于检测花叶海棠的SSR引物 组合, 由如下18个引物对中的全部或部分组成, 所述部 分为2个以上17个以下: 引物对1: 由SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示的两条 单链DNA组成; 引物对2: 由SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示的两条 单链DNA组成; 引物对3: 由SEQ ID No.5和SEQ ID No.6所示的两条 单链DNA组成; 引物对4: 由SEQ ID No.7和SEQ ID No.8所示的两条 单链DNA组成; 引物对5: 由SEQ ID No.9和SEQ ID No.10所示的两条 单链DNA组成; 引物对6: 由SEQ ID No.11和SEQ ID No.12所示的两条 单链DNA组成; 引物对7: 由SEQ ID No.13和SEQ ID No.14所示的两条 单链DNA组成; 引物对8: 由SEQ ID No.15和SEQ ID No.16所示的两条 单链DNA组成; 引物对9: 由SEQ ID No.17和SEQ ID No.18所示的两条 单链DNA组成; 引物对10: 由SEQ ID No.19和SEQ ID No.20所示的两条 单链DNA组成; 引物对11: 由SEQ ID No.21和SEQ ID No.22所示的两条 单链DNA组成; 引物对12: 由SEQ ID No.23和SEQ ID No.24所示的两条 单链DNA组成; 引物对13: 由SEQ ID No.25和SEQ ID No.26所示的两条 单链DNA组成; 引物对14: 由SEQ ID No.27和SEQ ID No.28所示的两条 单链DNA组成; 引物对15: 由SEQ ID No.29和SEQ ID No.30所示的两条 单链DNA组成; 引物对16: 由SEQ ID No.31和SEQ ID No.32所示的两条 单链DNA组成; 引物对17: 由SEQ ID No.33和SEQ ID No.34所示的两条 单链DNA组成; 引物对18: 由SEQ ID No.35和SEQ ID No.36所示的两条 单链DNA组成。 2.用于检测花叶海棠的S SR引物, 为权利要求1中所述18个引物对中的任意 一个。 3.用于检测花 叶海棠的SSR标记组合, 由18个SSR标记中的全部或部分组成, 所述部分 为2个以上17个以下; 所述18个SSR标记 为以花叶海棠基因组DNA为模板, 分别采用权利要求 1中所述18个引物对进行PCR扩增后所 得的18份扩增产物序列。 4.用于检测花叶海棠的S SR标记, 为权利要求3中所述18个S SR标记中的任意 一个。 5.用于检测花叶海棠的试剂盒, 含有权利要求1所述的SSR引物组合或权利要求2所述 的SSR引物。 6.权利要求1所述的SSR引物组合或权利要求2所述的SSR引物或权利要求3所述的SSR 标记组合或权利要求 4所述的S SR标记或权利要求5所述的试剂盒在 如下任一中的应用: (A1)对花叶海棠进行遗传多样性检测; (A2)对花叶海棠进行遗传图谱构建; (A3)对花叶海棠进行种质鉴定 。 7.一种对花叶海棠进行遗传多样性检测的方法, 包括如下步骤: (B1)分别以不同待测花叶海棠基因组DNA为模板, 采用权利要求1所述的SSR引物组合 或权利要求2所述的S SR引物进行PCR扩增, 得到扩增产物; (B2)将所述扩增产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳, 根据 所述不同待测花叶海棠间的条带 多态性进行花叶海棠进行遗传多样性分析。 8.根据权利要求7所述的方法, 其特征在于: 步骤(B1)中, 进行所述PCR扩增时, 组成所 述引物对的两条单链DNA分子和作为模板的花叶海棠基因组DNA的配比为5pmol: 5pom:权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 114836417 A 2125ng。 9.根据权利要求7或8所述的方法, 其特征在于: 步骤(B1)中, 进行所述PCR扩增时, 组成 所述引物对的两条单链DNA分子在反应体系中的终浓度均为0.5 μmol/L; 作为模板的花叶海 棠基因组DNA在反应 体系中的终浓度为12.5ng/ μL。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 114836417 A 3
专利 一种花叶海棠SSR标记的开发和应用
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