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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202211322242.3 (22)申请日 2022.10.27 (71)申请人 上海捷易生物科技有限公司 地址 201108 上海市闵行区春光路9 9弄18 号28号楼4楼 (72)发明人 颜进 陈珺 李艳艳 (74)专利代理 机构 上海互顺专利代理事务所 (普通合伙) 31332 专利代理师 韦志刚 曹月明 (51)Int.Cl. C12Q 1/6883(2018.01) C12Q 1/6851(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种用于新生儿免疫缺陷病筛查的试剂盒 及其制备方法 (57)摘要 本发明公开了一种用于新生儿免疫缺陷病 筛查的试剂盒及其制备方法, 所述试剂盒包括有 寡核苷酸序列组合、 阴性质控品和阳性质控品和 实时荧光PCR扩增的必要试剂Mg2+、 dNTPs、 DNA聚 合酶、 PCR缓冲液、 PCR增强剂等。 本申请通过设计 有通用引物Tag, 可以在多重荧光扩增体系中, 平 衡各引物对的扩增效率, 建立对ΔTREC和Δ KREC 的检测, 本申请检测的ΔTREC和ΔKREC指标, 相 比于定量TREC和K REC拷贝数, 具有受样本均一性 和核酸提取效率的影响较小, 检测成本低的优点 (不需要同步检测已知浓度的定量标准物质), 同 时ΔTREC和ΔKREC在新生儿人群中的分布是正 态的, 具有更好的可预测性, 更适合于大规模筛 查应用。 权利要求书2页 说明书5页 附图4页 CN 115449549 A 2022.12.09 CN 115449549 A 1.一种用于新生儿免疫缺陷病筛查的试剂盒, 其特征在于: 所述试剂盒包括有寡核苷 酸序列组合、 阴性质控品和阳性质控品和实时荧光PCR扩增的必要试剂Mg2+、 dNTPs、 DNA聚 合酶、 PCR缓冲液、 PCR增强剂等; 所述寡核苷酸序列组合 为: (01)GCGTGAC CTACTGACTC; (02)GCGTGATGCATCGTAC C; (03)GCGTGAC CTACTGACTCTGCTGACAC CTCTGGTTTTTGTAA; (04)GCGTGATGCATCGTAC CACTCGTGAGA ACGGTGAATGAAG; (05)CCCACTCCTGTGCACG GTGATGCAT; (06)GCGTGAC CTACTGACTCAGCTCAGCGC CCATTACGTT; (07)GCGTGATGCATCGTAC CAGGAGCCAGCTCTTACCCTAGAGT; (08)GTGCACAGTGTGCGCTGC CAACC; (09)GCGTGAC CTACTGACTCG GCCATATTACTGACCCTCTACAGA; (10)GCGTGATGCATCGTAC CGAAAGATCAAAGCCTTGCAGGTAAT; (11)ACCACCTGCCTTTATCCTGCAATACCA; 所述序列01和序列02为通用引物Tag序列, 所述序列03、 04、 06、 07分别为连接有通用引 物Tag序列的靶 标特异的序列, 所述序列05、 08、 11为荧光探针序列并分别检测TREC、 KREC和 B2M基因, 所述序列05设计于TREC连接点处并横跨连接点两侧, 所述序列06设计于KREC连接 点处并横跨连接点两侧; 新生儿免疫缺陷病筛查包括以下步骤: 第一步: 准备寡核苷酸序列组合、 阴性质控品和阳性质控品和实时荧光PCR扩增的必要 试剂Mg2+、 dNTPs、 DNA聚合酶、 PCR缓冲液、 PCR增强剂等备用; 第二步: 阳性质控品使用293T细胞系与商品化红细胞和血浆按比例混合, 之后制备成 干血片; 第三步: 阴性质控品使用基因敲入的293T细胞系与商品化红细胞和血浆按比例混合 后, 之后制备成干血斑片; 第四步: 将第三步的基因敲入的293T细胞系, 可使用CRISPR技术将TREC特征序列和 KREC特征序列敲入2 93T细胞系; 第五步: 将上述材 料放置于试剂盒内即可。 2.根据权利要求1所述的一种用于新生儿免疫缺陷病筛查的试剂 盒, 其特征在于: 所述 序列05、 08、 11的荧光报告基团可互不干涉地选自FAM、 HEX、 VIC、 ROX、 JOE、 CY3、 CY5、 CY5.5、 TET和5‑TAMRA等, 所述序列05、 08、 11的荧光报告基团可根据荧光报告集团的匹配性选自 BHQ0、 BHQ1、 BHQ2、 BHQ3、 MGB、 Dabcyl、 TAMRA等。 3.根据权利要求1所述的一种用于新生儿免疫缺陷病筛查的试剂盒制备方法, 其特征 在于: 所述第五步中TRE C特征序列为: GCTCTGAAAGGCAGAAAGAGGGCAGCCCTCTCCAAGGCAAAATGGGGCTCCTGTGGGGAACAGAGGGGTGCC TCTGTCAACAAA GGTGATGCCACATCCCTTTCAACCATGCTGACACCTCTGGTTTTTGTAAA GGTGCCCACTCCTG TGCACGGTGATGCATA GGCACCTGCACCCCGTGCCTAAACCCTGCA GCTGGCACGGGCCCTGTCTGCTCTTCATTC ACCGTTCTCACGAGTTGCAATAA GTTCAGCCCTCCATGTCACACTGTGTTTTCCATCCTGGGGA GTGTTTCACA GC权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 115449549 A 2TATCCCAAGCCCCACGCTGA。 4.根据权利要求1所述的一种用于新生儿免疫缺陷病筛查的试剂盒及其制备方法, 其 特征在于: 所述第五步中KRE C特征序列为: TGGAAATTTTCACTAATGAGATATCATAATGAATGTGAATTTTATTTCTGAAATCTCTAATAAATCAGTCTT CTCCCTGGTTTTCCCA GCTCAGCGCCCATTACGTTTCTGTTCTCTTTCCCTTA GTGGCATTATTTGTATCACTGTG CACAGTGTGCGCTGCCAACCTGCTGCCCGTGCA GAAACTCTA GGGTAAGAGCTGGCTCCTGGAGTCCCACCCA GGC TGCGTGTC CCTCACAGTCTGCTCTGTGTCTATGTGTGTGTGT TGGGGGGATATTATTGGACAATTCAAGGGAGGCT。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 115449549 A 3
专利 一种用于新生儿免疫缺陷病筛查的试剂盒及其制备方法
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