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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210779084.8 (22)申请日 2022.06.30 (71)申请人 湖南家辉生物技 术有限公司 地址 410205 湖南省长 沙市高新 开发区麓 谷麓景路2号 (72)发明人 曾桥 李婵艺 刘鑫林 (74)专利代理 机构 北京高沃 律师事务所 1 1569 专利代理师 苏士莹 (51)Int.Cl. C12Q 1/6883(2018.01) C12N 15/11(2006.01) C12Q 1/6858(2018.01) (54)发明名称 一种新的N IPBL突变基因及其诊断试剂 (57)摘要 本发明提供了一种新的NIPBL突变基因及其 诊断试剂, 属于医学诊断技术领域。 本发明通过 外显子组测序技术首次发现了NIPBL:NM_ 133433.4:exon3:c.111_112insCA:p.K38Qfs*8 位点发生突变可以导致德朗热综合征。 本发明的 研究成果可以用于德朗热综合征的遗传学诊断, 为德朗热综合征的发病机制研究提供了新的基 础和途径, 为德朗热综合征的治疗提供新的理论 依据, 可以为治疗德朗热综合征提供可能的药物 靶点。 权利要求书1页 说明书17页 序列表7页 附图2页 CN 115216536 A 2022.10.21 CN 115216536 A 1.一种德 朗热综合征的新型诱导基因, 其特征在于, 所述新型诱导基因包括在NIPBL: NM_133433.4:exon3:c.111_112insCA:p.K38Qfs*8位 点发生突变。 2.一种由权利要求1所述新型诱导基因引发的德朗热综合征的检测试剂, 其特征在于, 所述检测试剂包括针对所述 新型诱导基因的突变位 点设计的特异性扩增引物。 3.根据权利要求1所述检测试剂, 其特征在于, 所述特异性扩增引物包括NIPBL ‑F和 NIPBL‑R, 所述NIPBL ‑F的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示, 所述NIPBL ‑R的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。 4.一种德朗热综合征的检测试剂盒, 其特 征在于, 包括权利要求2或3所述检测试剂。 5.根据权利 要求4所述检测试剂盒, 其特征在于, 还包括PCR扩增反应的试剂, 和/或DNA 测序时所需的试剂和 测序引物。 6.根据权利要求5所述检测试剂盒, 其特征在于, 所述测序引物包括NIPBL ‑Seq1和 NIPBL‑Seq2, 所述NIPBL ‑Seq1的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示, 所述NIPBL ‑Seq2的核苷酸 序列如SEQ ID NO.4所示。 7.权利要求2或3所述检测试剂或权利要求4~6任一项所述检测试剂盒在制备德朗热 综合征的诊断试剂中的应用。 8.根据权利要求7 所述应用, 其特 征在于, 所述诊断试剂的检测样本包括血 液或羊水。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 115216536 A 2一种新的NIPBL突变基因及其诊断试剂 技术领域 [0001]本发明属于医学诊断技 术领域, 具体涉及一种新的N IPBL突变基因及其诊断试剂。 背景技术 [0002]德朗热综合征(Corneliade Lange syndrome, CdLS)(MIM 122470)是一种较为罕 见的遗传性疾病, 1933年荷兰的儿科医生Cornelia de Lange对有相同临床特征的患儿进 行了首次归纳总结, 并以其名命名该类疾病。 该病是一种多器官系统受累的遗传性疾病, 其 表现出显著的遗传异质性, 临床表现轻重不一, 典型患者具有 特殊面容、 严重生长落后及肢 体畸形等特点。 据估计, CdLS的发病率为(1.6~2.2)/10万, 但轻型患者可能未被诊断出, 故 确切的发病率尚不清楚。 CdLS为显性遗传, 大多为散发, 亦有家族性发病的报道。 其主要由 黏连蛋白复合体的相关基因变异导 致。 [0003]目前发现, 至少有7个基因[NIPBL(Nipped ‑B‑like protein)基因、 SMC1A基因、 SMC3基因、 RAD21基因、 溴结构域蛋白4(bromodo main‑containing protein4, BRD4)基因、 组 蛋白去乙酰化酶8(histone deacety lase 8, HDAC8)基因和锚蛋白重复域11(ankyrin repeat domain 11, ANKRD11)基因]与CdLS相关, 其中SMC1A基因、 SMC3基因、 RAD21基因编码 黏连蛋白的构成组分, NIPBL基因、 HDAC8基因是黏连蛋白的调控因子, 最常见突变基因为 NIPBL基因突变。 [0004]NIPBL(MIM 608667)基因变异被首次鉴定出是CdLS的致病原因。 NIPBL基因是定位 于染色体5p13.2, 包括47个外显子和46个内含子, 基因长189.6kb, 编码2804个氨基酸的 NIPBL蛋白, 该蛋白属于染色体黏附素家族, 参与构成黏连蛋白加载到染色体上所需的异二 聚体复合物。 约70%的CdLS患者中存在NIPBL基因变异。 目前已报道三百多种变异, 包括错 义变异、 无义变异、 剪接变异、 插入、 缺 失/重复等。 NIPBL基因剂量效应对 人类的发育极为重 要, 基因表达减少15%可导致CdLS表型。 而对NIPBL基因变异致病机制中, NIPBL影 响转录调 控可能通过两种途径: 通过对黏连蛋白的加载作用来间接影响调控或直接与启动子作用。 [0005]因此, 基因突变是导致疾病 发生发展的重要遗传基础, 基因诊断是确诊德朗热综 合征的重要遗传学标准。 临床上需要针对不同突变建立相应的检测技术并用于明确病因和 疾病诊断。 发明内容 [0006]有鉴于此, 本 发明的目的在 于提供一种新的NIPBL突变基因及其诊断试剂, 首次发 现NIPBL一种新型突变, 可导致德朗热综合征, 并据此研制相应的诊断试剂盒, 助力德朗热 综合征基因突变的筛查和诊断, 并为 其药物筛 选、 药效评价及靶向治疗提供新的技 术支持。 [0007]为了实现上述发明目的, 本发明提供以下技 术方案: [0008]本发明提供了一种德朗热综合征的新型诱导基因, 所述新型诱导基因包括在 NIPBL:NM_13 3433.4:exon3:c.111_112insCA:p.K38Qfs*8位 点发生突变。 [0009]本发明所述c.111_112 insCA突变指野生型NIPBL基因的第3号外显子的第111_112说 明 书 1/17 页 3 CN 115216536 A 3
专利 一种新的NIPBL突变基因及其诊断试剂
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