(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210571102.3 (22)申请日 2022.05.24 (71)申请人 沧州市农林科 学院 地址 061001 河北省沧州市运河区学院路 (72)发明人 王伟　邹景伟　王志　王伟伟　 李孟军　于亮　钮力亚　张玉杰　 王奉芝　王连鹏　 (74)专利代理 机构 北京聿华联合知识产权代理 有限公司 1 1611 专利代理师 贾艳华 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种影响小麦耐盐性的SNP和单倍型 (57)摘要 本发明涉及一种影 响小麦耐盐性的SNP和单 倍型。 所述SNP的核 酸的序列如SEQ  IDNo.5所示， 所述SNP位于SEQ  ID No.5上的从5 ’端起的第 1014位点， 为T或C。 所述单倍型的核酸的序列如 SEQ ID No.5所示， 所述单倍型的9个SNP差异位 点别为如SEQ  IDNo.6所示的从5 ’到3’端的第 1014位的C>T， 第1183位的T>G， 第 1185位的C>G， 第1189位的G>A， 第1191位的G>T， 第1202位的T> A， 第1204位和12 05位AT缺失， 第1243位的T>A， 第 1247位后ACTG的插 入。 权利要求书2页 说明书9页 序列表4页 CN 115094155 A 2022.09.23 CN 115094155 A 1.一种小麦的SNP， 所述SNP的核酸的序列如SEQ  ID No.5所示， 所述SNP位于SEQ  ID  No.5上的从5 ’端起的第1014 位点， 为T或C 。 2.一种小麦 的单倍型， 所述单倍型的核酸的序列如SEQ  ID No.5所示， 所述单倍型的9 个SNP差异位点分别为如SEQ  ID No.6所示的从5 ’到3’端的第1014位的C>T， 第1183位的T> G， 第1185位的C>G， 第1189位的G>A， 第1191位的G>T， 第1202位的T>A， 第1204位和1205位AT 缺失， 第1243位的T>A， 第1247位后ACTG的插 入。 3.一种小麦的KASP基 因分型引物， 其序列如SEQ  ID No.7、 SEQ  ID No.8和SEQ  ID No.9 所示。 4.根据权利 要求1所述的SNP、 权利 要求2所述的单倍型和权利要求3所述的KASP基因分 型引物在用于确定小麦耐盐中的应用。 5.根据权利要求4所述的应用， 其特征在于， 所述小麦的品种为中国春、 gary、 Alzada   dorum、 brundage、 Dw、 coda  club、 broundage、 Deloris、 UI  dorwin、 weston、 boundary、 石矮1 号、 石矮2号、 烟农19、 烟农15、 渭麦9号、 师栾02 ‑1、 藁优5766、 藁优5218、 藁优8901、 新麦26、 新麦28、 济麦44、 济南17、 济麦22、 济紫麦1号、 济旱5036、 济麦106、 济农CH02、 济麦52、 济麦 38、 济麦60、 济4099、 石麦27、 石麦25、 石11 ‑7091‑1、 石T10‑153‑3、 石优20、 石麦22、 石优17、 石15鉴21、 安科4157、 硬早2018、 良星99、 良星66、 良星77、 滨州16 ‑3、 滨州16 ‑4、 商355、 驻麦 305、 驻麦328、 驻麦 762、 商农5、 衡16观71、 衡Y16 ‑5335、 衡Y16 ‑6127、 衡16 ‑5365、 衡H16观44、 衡H165087、 衡1442、 衡Y16观 164、 衡16观136、 17初113、 17初12 1、 兰天45、 兰天01 ‑308、 兰天 36、 兰天40、 兰天31、 兰天42、 兰天43、 兰天26、 兰天44、 兰天39、 兰天33、 兰天34、 兰天10 ‑2、 兰 天13‑16、 兰天15、 兰天19、 兰天21、 兰天31、 兰天46、 兰天47、 兰天48、 兰天49、 兰天50、 兰天 52、 金禾912 3、 金禾12 339、 金禾13294、 运旱102、 运8427、 运麦3101、 兰天01 ‑309、 运旱179、 运 旱625、 运旱115、 运旱618、 运旱137、 运旱22 ‑33、 运旱1号、 运8444、 运83083、 运丰旱2号、 运 8376‑3、 临旱5325、 临旱955、 临176038、 临优165、 临汾5064、 临农11、 临17鉴21、 盐92 ‑8014、 盐科8、 金麦529 5、 长9194、 长8744、 长4783、 长43 78、 邢麦13、 邢麦18、 邢麦2 0、 郑麦1860、 郑麦 136、 郑麦103、 郑品麦22号、 郑麦132、 郑麦119、 烟农173、 烟农999、 山农25、 山农29、 山农30、 红蚂蚱、 茶淀红、 科遗29、 科遗26、 沧麦119、 沧麦6002、 沧麦6003、 沧麦6004、 沧麦6005、 沧核 030、 沧麦028、 科农2 011、 科农92 04、 科农2009、 Kn1002、 科兴3302、 科兴789、 沧红、 临WX88、 菏 麦0746‑2、 菏麦26、 菏麦28、 菏麦30、 漯麦163、 长航一号、 九丰抗条9、 小黑麦、 长载734、 轮选 166、 泉麦29、 农大2011、 珍麦3号、 泰禾麦2号、 中农麦4007、 丹麦118、 紫麦19、 濮兴0369、 豫农 186、 泛育麦17、 新麦35、 中育1220、 平安0518、 淮麦4046、 许科918、 涡 麦1212、 丰德存麦16号、 机麦211、 赛德麦5号、 冀麦32、 存麦11号、 安科1405、 龙麦30、 龙麦35、 龙麦39、 山农紫麦1号、 16YA67、 DC3688、 16YA24、 漯麦906、 漯麦163、 鲁麦14、 鲁麦2 1、 耐盐78、 耐盐101、 西农528、 德 抗961、 山融3号、 衡9966、 衡观35、 轮选48、 轮选49、 轮选145、 淄麦61、 淄麦29、 淄麦28、 Kn8024、 hop e、 土耳其B17G2805、 大青芒B16G0009、 铜麦6号、 临Y8155、 菏麦0839、 菏麦0662 ‑ 12、 并麦3号、 石17T5248、 运旱1512、 运旱805、 运旱139 ‑1、 并195、 并192、 太113、 晋作 80、 鲁原 148、 鲁研128、 鲁原118、 菏麦19、 菏麦20、 菏麦21、 菏麦22、 菏麦23、 菏麦24、 菏麦25、 菏麦 0711、 菏麦08139、 菏麦029、 晋麦84、 运麦14观74、 邢麦18、 邢麦27、 邢麦26、 中麦29、 中麦30、 中麦31、 科农1223、 冀资麦14号、 冀资麦8号、 河农6119、 河农3320、 河农6133、 衡9966、 衡 H116021、 衡Y166076、 金禾330、 金禾14219、 金禾15310、 金禾16294、 冀资麦9号、 冀麦161、 临权　利　要　求　书 1/2 页 2 CN 115094155 A 2研16、 临育18、 17初12 0、 济农CH03、 洛农17 103、 邯15 ‑5097、 邯14 ‑5337、 邯麦19、 临805临801、 临176038、 临农1 1和沧麦6001中的至少一种。 6.一种小麦耐盐性能的鉴定方法， 其包括如下步骤： 确定小麦中的如权利要求1所述的SNP， 如果所述SNP位点为T/T或C/T， 则为耐盐型， 如 果所述SNP位 点为C/C， 则为盐敏感型。 7.一种小麦遗传改良的方法， 所述方法包括： 确定小麦品系的如权利要求1所述的SNP， 并根据所述SNP做出相应的选择： 在所述小麦品系中选择在所述SEQ  ID No.5上的从5 ’端起的第1014位点为T/T和C/T基 因型的个体， 淘汰在该位点为C/C基因型的个体， 以逐代 提高该位点的等位基因T的频率； 优 选在所述SEQ  ID No.5上的从5 ’端起的第1014位点为T/T基因型的个体， 淘汰在该位点为C/ T和C/C基因型的个 体， 以逐代提高该位 点的等位基因T的频率。 8.根据权利要求6或7所述的方法， 其特征在于， 利用分析所述小麦的核酸的序列来确 定其中的如权利要求 1所述的SNP或如权利要求2所述的单倍型， 其中所述核酸的序列如S EQ  ID No.5所示。 9.根据权利 要求6或7所述的方法， 其特征在于， 利用如权利要求3所述的KASP基因分型 引物分析 所述小麦的核酸的序列来确定其中的如权利要求1所述的SNP。 10.一种改善小麦耐盐性 能的小麦新品系和/或小麦新品种建立的方法， 其包括如下步 骤： 对于如权利要求1所述SNP的基因型为C/T或C/C的小麦， 通过定点突变将其中的C/T和C/ C突变为T/T基因型。权　利　要　求　书 2/2 页 3 CN 115094155 A 3