(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210676928.6 (22)申请日 2022.06.15 (71)申请人 安徽农业大 学 地址 230036 安徽省合肥市蜀山区长江西 路130号 (72)发明人 金四华　郑书丽　郭立平　耿照玉　 曹程程　江洪峰　贾富民　丁元飞　 张泰康　王鑫　 (74)专利代理 机构 合肥和瑞知识产权代理事务 所(普通合伙) 34118 专利代理师 王挺 (51)Int.Cl. C12Q 1/6888(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种地方鸡剩余采食量相关的分子标记及 其应用 (57)摘要 本发明涉及一种地方鸡剩余采食量相关的 分子标记及其应用。 该SNP分子标记的位点在鸡 的2号染色体第6369214号位， 该位点的碱基由C 突变为T。 本发明通过MALDI ‑TOF MS技术对 PRKAG2中不同SNPs位点进行分型， 并与饲料利用 率性状进行关联分析， 得到一组最佳的与剩余采 食量RFI相关的位点， 为鸡的饲料利用率性状的 选育和分子标记辅助育种提供重要的参考依据， 在高饲料利用率鸡新品种和新品系分子育种方 面具有广阔的应用前 景。 权利要求书1页 说明书7页 附图4页 CN 115261485 A 2022.11.01 CN 115261485 A 1.一种地方鸡剩余采食量相 关的SNP分子标记， 其特征在于， 该SNP分子标记的位点在 地方鸡的2号染色体第6369214号位， 该位点的碱基由C突变为T， 所述地方鸡是指皖南三黄 鸡或淮北 麻鸡或淮南麻黄鸡或五华鸡或天长三黄鸡。 2.根据权利 要求1所述的SNP分子标记， 其特征在于， 所述SNP 分子标记的序列如SEQ  ID  NO： 1所示， 所述SEQ  ID NO： 1所示序列自5 ’端起第45 0位碱基是T。 3.一种如权利要求1或2所述的SNP分子标记的应用， 其特征在于， 所述SNP分子标记用 于预测或辅助预测高饲料利用率的所述地方鸡； 或所述SNP分子标记用于选育不同饲料利 用率的所述 地方鸡。 4.一种用于检测如权利要求1或2所述的SNP分子标记的引物， 其上游引物的序列如SEQ   ID NO.2所示， 下游引物的序列如SEQ  ID NO.3所示， 延伸引物的序列如SEQ  ID NO.4所示。 5.一种如权利要求1或2所述的SNP分子标记在制备检测地方鸡饲 料利用率的试剂 盒中 的应用。 6.一种用于检测如权利要求1或2所述的SNP分子标记的试剂 盒， 其特征在于， 所述试剂 盒包括用于检测SNP分子标记的引物， 所述引物中， 上游引物序列如SEQ  ID NO.2所示， 下游 引物序列如SEQ  ID NO.3所示， 延伸引物的序列如SEQ  ID NO.4所示。 7.一种利用如权利要求1或2所述的SNP分子标记筛选高饲料利用率地方鸡的方法， 其 特征在于， 检测地方鸡的2号染色体上第6369214号位点的基因型， 基因型为CC的个体为高 饲料利用率鸡。 8.如权利要求7 所述的筛 选高饲料利用率 地方鸡的方法， 其特 征在于， 包括以下步骤： S1.提取待测地方鸡的总DNA， 对提取到的DNA进行PCR扩增， 得到PCR扩增产物； 所述PCR 扩增使用的引物对， 其上游引物的序列为SEQ  ID NO.2， 下游引物的序列为SEQ  ID NO.3； S2.在PCR扩增产物进行测序， 获得测序结果； S3.筛选出2号染色体上第6 369214号位点的个体基因型为C C。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 115261485 A 2一种地方鸡剩余采食量相关的分子标记及其应用 技术领域 [0001]本发明涉及分子标记技术领域， 尤其涉及 一种地方鸡剩余采食量相关的分子标记 及其应用。 技术背景 [0002]家禽生产中， 饲料成本占总成本的70％以上， 提高畜禽的产出和生产价值， 特别是 肉用畜禽， 努力提高饲料利用率是必然选项。 [0003]剩余采食量(FRI)是评价动物饲料效率的一个新的选择性状， 它是实际采食量与 预测采食量之间的差值。 剩余采食量与机体组成、 营养物质的消化率、 新陈代谢能力、 基础 代谢、 能量效率、 活动量、 免疫反应等生物学因素密切相关， 选择低剩余采食量的个体可以 提高饲料利用率， 降低饲养成本， 是提高经济家禽养殖效益关键因素之一。 [0004]地方鸡是家鸡因不 同地区的自然条件、 农业生产、 饲养管理方式和社会需要等条 件下， 经长期选育出来的品种， 目前我国地方鸡约有60种之多， 其中包括文昌鸡、 桃源鸡等 优质品种。 地方鸡是一种重要的地方家 禽资源， 其各具一定的优良特性或特征， 特别是具有 适应当地环境条件， 耐粗饲， 抗病力强， 肉质优良等特点， 是进行新品系选育或培育新品种 重要的原 始材料。 [0005]地方鸡种采食量就单纯采用常规选择， 其遗传改良效率不高， 利用基因标记进行 分子标记辅助选育可以从遗传上根本改良选择性状， 从而加速遗传进展。 剩余采食量作为 鸡遗传改良工作中的一种重要经济性状， 尚缺乏用于鉴定的分子标记。 发明内容 [0006]为了解决现有技术中存在的问题， 本发明提供了一种地方鸡剩余采食量相关的 SNP分子标记， 该SNP分子标记的位点在地方鸡的2号染色体第6369214号位， 该位点的碱基 由C突变为T。 所述地方鸡是指皖南三黄鸡或淮北麻鸡或淮南麻黄鸡或五华鸡或天长三黄 鸡。 [0007]优选的， 所述SNP分子标记的序列如SEQ  ID NO： 1所示， 所述SEQ  ID NO： 1所示序 列自5’端起第45 0位碱基是T。 [0008]上述SNP分子标记的应用包括： 所述S NP分子标记用于预测或辅助预测高饲料利用 率地方鸡； 或所述SNP分子标记用于 选育不同饲料利用率 地方鸡。 [0009]本发明提供一种用于检测如上述SNP分子标记的引物， 其上游引物的序列如  SEQ  ID NO.2所示， 下游引物的序列如SEQ  ID NO.3所示， 延伸引物的序列如SEQ ID  NO.4所示。 [0010]本发明提供一种上述SNP分子标记在制备检测地方鸡饲料利用率的试剂盒中的应 用。 [0011]本发明提供一种用于检测上述SNP分子标记的试剂盒， 所述试剂盒包括用于检测 SNP分子标记的引物， 所述引物中， 上游引物序列如SEQ  ID NO.2所示， 下游引物 的序列如 SEQ ID NO.3所示， 延伸引物的序列如SEQ  ID NO.4所示。说　明　书 1/7 页 3 CN 115261485 A 3