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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210932113.X (22)申请日 2022.08.04 (71)申请人 云南省烟草农业科 学研究院 地址 650000 云南省昆明市五华区 圆通街 33号 (72)发明人 盖晓彤 冯智宇 姜宁 卢灿华 夏振远 韩天华 户艳霞 代快 杨海林 王继明 (74)专利代理 机构 成都市鼎宏恒业知识产权代 理事务所(特殊普通合伙) 51248 专利代理师 张勋 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12N 15/11(2006.01)C12R 1/77(2006.01) (54)发明名称 一种共享镰刀菌的检测方法及其应用 (57)摘要 本发明涉及一种共享镰刀菌的检测方法及 其应用, 所述的检测方法包括特异性引物组: Fc ‑ geno‑1F/Fc‑geno‑1R。 本发明有益效果为, 1、 现 有技术中没有针对PCR检测烟草镰刀菌根腐病病 原菌共享镰刀菌的特异性引物, 本发 明实现了零 的突破; 2、 本发明研究筛选 出的引物具有极高的 准确度和特异性; 3、 综合使用本发明的方法, 其 最大灵敏度可达1.0ng/μL; 4、 本发明的应用在 于检测疑似被共享镰刀菌侵染的烟株最小时间 为12小时; 5、 本发明能在接种共享镰刀菌后早期 检测到病原菌, 达到烟草镰刀菌根腐病早期检测 的目的, 对于烟草镰刀菌根腐病的早期检测, 预 防和控制具有非常重要的意义和重大的经济意 义。 权利要求书2页 说明书6页 附图3页 CN 115161412 A 2022.10.11 CN 115161412 A 1.一种共享镰刀菌的检测方法, 其特 征在于, 所述的检测方法包括特异性引物组: 正向引物Fc ‑geno‑1F: 5′ ‑TACAAGAGCTTAATGAGATTGC‑3′; 反向引物Fc ‑geno‑1R: 5′ ‑CTCCTCCGTTGTTGGTGATT‑3′。 2.根据权利要求1所述的检测方法, 其特征在于, 所述的特异性引物组Fc ‑geno‑1F/Fc‑ geno‑1R对应的扩展片段大小为440bp; 序列 为TACAAGAGCTTAATGAGATTGCGGAGAAGTACTCACG CTCCCGTAA GGCCCACGATCCGAA GCGATACACGGATAA GGTCAAATGGTTCTCCGATGCAA GCAAGATCGAAGAG CTTCAAGAAA GAGCCCAGGCTACTAA GTCCAATCTTCACATGGCCATCACCTTTA GGGTTTCTTCTATGGTA GATA GGGGAAATGTGCGACA GGAAGTGAGTTCTCAGGGTGTCGTCTGTTGTCTAAACTGACACGTTGACGGTCTCTTTCA CCGCGTGGCACAACA GTTGACTTACTATACGCAAAA GACTCATAATATCTCTCAAACATTACCCAA GTTACTCCAA GGACCACACCCCAA GCCAGAAAATTCAACCGCAA GCCTACAACCCGCGACTGAA GGCACAACGATTCACCACAA GC CCGAATCACCAACAACGGAGGAG。 3.根据权利要求2所述共享镰刀 菌的检测方法, 其特征在于, 所述的检测方法包括以下 步骤: S1: 提取待检测样品DNA; S2: 以待测样品为DNA为模板, 采用一对引物进行PCR扩增; S3: 扩增产物琼脂糖凝胶电泳分析。 4.根据权利要求3所述共享镰刀菌的检测方法, 其特征在于, 所述步骤S1中提待检测样 品DNA的具体步骤如下: S11: 称取待检测样品0.1g左右, 加液氮在研钵中用研磨棒研磨成细末, 将细末转移至 离心管中, 加入600 μL预热至65℃的CTAB提取液, 颠倒混匀, 65℃水浴30~60min; 所述步骤 S11中的CTAB提取 液含2%巯基乙醇; S12: 取出离心管冷却至室温, 加入600μL氯仿: 异戊醇溶液, 振荡混匀, 12000rpm离心 15min, 取400 μL上清液移至 离心管中; 所述 步骤S12中的氯仿: 异戊醇体积比为24:1; S13: 取上清液离心管中, 加入等倍体积的预冷的异丙醇, 轻轻颠倒混匀, ‑20℃放置 30min以上, 120 00rpm离心10mi n; S14: 去掉上清液, 加入70%无 水乙醇清洗1次, 120 00rpm离心10mi n; S15: 去掉上清液, 加入95%无水 乙醇再清洗1次, 12000rpm离心5min, 室温干燥后用适 量无菌ddH2O溶解沉淀的DNA, ‑20℃保存备用。 5.根据权利要求3所述共享镰刀菌的检测方法, 其特征在于, 所述步骤S2中PCR扩增的 反应体系总体积为2 5 μL, 包括10×Taq PCR buffer 2.5 μL, 2.0 μL dNTP各0.25mmol/L, 1.0U Taq聚合酶5U/ μL, 1.0 μL上 下游引物5 ×10‑3mmol/L, 1 μL模板DNA, 无菌d dH2O补足至25 μL。 6.根据权利要求3所述共享镰刀菌的检测方法, 其特征在于, 所述步骤S2中PCR扩增程 序为: 94℃预变性3min, 94℃变性1min, 55℃退火30s, 72℃延伸30s, 30个循环, 72℃延伸 7min。 7.根据权利要求3所述共享镰刀菌的检测方法, 其特征在于, 所述步骤S3 中琼脂糖凝胶 电泳采用1%的琼脂糖凝胶, 采用13 0V恒压电泳25mi n。 8.权利要求1或2所述检测方法在于烟草镰刀 菌根腐病的早期检测、 预防和控制中的应 用。 9.根据权利要求8所述的应用, 其特 征在于, 检测共享镰刀菌的灵敏度为1.0ng/ μL。权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 115161412 A 210.根据权利要求8所述的应用, 其特征在于, 检测疑似被共享镰刀菌侵染的烟株最小 时间为12小时。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 115161412 A 3
专利 一种共享镰刀菌的检测方法及其应用
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