(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210687042.1 (22)申请日 2022.06.16 (71)申请人 兰州大学 地址 730000 甘肃省兰州市城关区天水南 路222号 (72)发明人 王维民　崔盼盼　张小雪　张德印　 李冲　黄永亮　赵利明　杨晓斌　 (74)专利代理 机构 北京智为时代知识产权代理 事务所(普通 合伙) 11498 专利代理师 王加岭　杨静 (51)Int.Cl. C12Q 1/6888(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种与绵羊尾 脂相关的分子标记及应用 (57)摘要 本发明提供了一种与绵羊尾脂相关的分子 标记及应用。 本发明通过对绵羊TRAPPC9基因进 行PCR扩增和序列分析， 发现在扩增片段的第132 位存在一个A/G多态性位点， 进一步使用KASPar 引物对1162只湖羊的多态性位点进行检测和建 立最小二乘模型， 对基因型与脂肪性状进行关联 分析， 最终确定了本发明扩增的TRAPPC9基因片 段可以作为与绵羊尾脂相关的分子标记。 本发明 通过检测分子标记， 可选留GG纯合的绵羊进入核 心群用于育种， 可用于降低绵羊的尾部脂肪沉 积， 有助于增 加经济效益。 权利要求书1页 说明书6页 序列表2页 附图2页 CN 115125309 A 2022.09.30 CN 115125309 A 1.一种与绵羊尾脂性状相关的分子标记， 其特征在于， 其核苷酸序列如SEQ  ID NO.1所 示， 其中第132bp处的R表示A或G， 该突变导 致分子标记的A/G多态性。 2.一种检测权利要求1所述的分子标记的PCR引物对， 其特征在于， 其包括如SEQ  ID  NO.2所示核苷酸序列的上游引物和如SEQ  ID NO.3所示核苷酸序列的下游引物。 3.一种检测权利 要求1所述的分子标记的KASPar引物对， 其特征在于， 其包括如SEQ  ID  NO.4所示核苷酸序列的A1， 如SEQ  ID NO.5所示核苷酸序列的A2和如SEQ  ID NO.6所示核苷 酸序列的引物C 。 4.检测权利要求1所述的分子标记的检测试剂 盒， 其特征在于， 其包含权利要求2的PCR 引物对或权利要求3所述的KAS Par引物对。 5.检测权利要求1所述的分子标记的方法， 其包括如下步骤： 1)使用权利要求2的PCR引物对或权利要求3所述的KASPar引物对， 或者使用权利要求4 所述的试剂盒， 对绵羊基因 组DNA进行扩增； 2)对步骤1)获得扩增产物的多态性 位点进行分型鉴定 。 6.根据权利要求5所述的方法， 其特征在于， 步骤b)中的分型鉴定方法为测序法、 基因 芯片法、 荧 光探针法或高分辨 率溶解曲线法。 7.根据权利要求5所述的方法， 其特征在于， 利用权利要求3所述的KASPar引物对进行 PCR扩增， 扩增结束后， 再通过检测荧 光信号确定分型 结果。 8.权利要求1所述的分子标记或权利要求2所述的PCR引物对或权利要求3所述的 KASPar引物对， 或权利要求4所述的试剂盒， 或权利要求5 ‑7任一项所述的方法在绵羊尾脂 性状检测中的应用。 9.权利要求1所述的分子标记或权利要求2所述的PCR引物对或权利要求3所述的 KASPar引物对或权利要求4所述的试剂盒， 或权利要求5 ‑7任一项所述的方法在绵羊育种中 的应用。 10.根据权利要求9所述的应用， 其特征在于， 其育种目的是为挑选出低尾脂沉积型绵 羊。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 115125309 A 2一种与绵羊尾脂相关的分子标记及应用 技术领域 [0001]本发明属于分子标记的技术领域， 具体涉及TRAPPC9基因片段作为影响绵羊尾脂 的分子标记及其应用。 背景技术 [0002]湖羊是中国太湖流域地区重要的畜牧品种之一。 它们具有繁殖性能高(发情期长， 平均产仔数2.06)、 生长发育性能快、 环境适应性强、 泌乳性能好等优点。 如今， 羊可以根据 尾巴的大小分为 五种类型： 短肥尾羊、 长肥尾羊、 短细尾羊、 长细尾羊和肥臀羊； 5000年前首 次记录了重要的肥尾羊品种， 湖羊属于短肥尾羊。 脂肪组织在维持家畜体内稳态代谢过程 的平衡中起着至关重要的作用； 并且存在于绵羊身体的各个部位， 包括肾周、 肠系膜和尾 巴； 尾部脂肪是最典型的沉积脂肪类型。 在恶劣的条件下， 例如迁移、 干旱和冬季导致的食 物短缺， 尾部脂肪 可以提供能量。 脂肪对人类具有附加价值， 因为它可以在干旱和饥荒期间 提供高能量食物。 目前， 随着人们生活水平和饮食 结构的提高， 消费者对自身健康和肉质的 关注度越来越高。 然而， 对于肥尾羊来说， 大部分脂肪沉积在尾部， 导致身体其他部位的脂 肪沉积减少， 从而影响肉质。 在现代羊肉生产系统中， 尾部脂肪沉积 需要更高的能源成本。 此外， 尾部脂肪占胴体重量的20％， 大大降低了胴体的经济价值， 增加了饲养成本。 因此， 减 少尾部脂肪沉积已成为绵羊遗传改良的研究热点。 [0003]NIK和IKKβ 结合蛋白(NIBP)， 也称为运输蛋白颗粒复合物9(TRAPPC9)， 是一种核因 子kappa B(NF‑κB)信号通路调节因子， 已在人体神经细胞中检测到。 很明显， 根据其特定功 能， TRAPP复合体可能 以不同的形式存在。 此外， NF ‑κB信号通路是肿瘤发生中细胞增殖、 凋 亡以及生理和病理事件的关键介质。 王等人对中国荷斯坦奶牛进行了全基因组关联研究， 结果支持存在显着的单核苷酸多态性(SNP)， 主要位于中国荷斯坦奶牛的常染色体(BTA) 14， 揭示了一个新的候选基因， TRAPP C9与奶牛乳 腺炎抗性相关的基因。 另一项研究表明， 小 头畸形和肥胖是TRAPPC9缺陷患者(12/23例)的共同特征， 并在TRAPPC9缺陷小鼠模型中总 结了这种表型。 Briollais等人表明纯母乳喂养(EBF)的平均效果与出生后头两年TRAPPC9   CpG基因座的M值降低0.06相关， 这导致体重指数(B MI)降低0.20kg/m2。 在Liang等人的一项 研究中， 删除小鼠中的TRAPPC9会导致小鼠体重显着增加， 得出的结论是TRAPPC9功能的丧 失导致体重增加。 刘等人结果表明TRAPP C9与猪的体型特征有关， 其中它参与调节骨骼 生长 发育和营养吸收， 并与肥胖有关。 然而， 目前还没有关于TRAPPC9的多态性与胡羊脂肪沉积 相关性状相关的报道。 [0004]因此， 在本研究中， 我们分析了TRAPPC9的SNP与湖羊脂肪沉积相关性状之间的关 系。 该研究为胡羊育种提供了有价 值的分子标记。 发明内容 [0005]为了解决上述技术问题， 本发明提供一种作为与绵羊尾脂相关的分子标记及 其应 用。 本发明的分子标记是从绵羊TRAPPC9基因中扩增得到， 其具体核苷酸序列如SEQ  ID 说　明　书 1/6 页 3 CN 115125309 A 3