(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202211303789.9 (22)申请日 2022.10.24 (71)申请人 江南大学 地址 214122 江苏省无锡市滨湖区蠡湖大 道1800号 (72)发明人 陈建欢　何雨珊　钱程佳　任春艳　 陶寄　魏志远　 (74)专利代理 机构 哈尔滨市阳光惠远知识产权 代理有限公司 2321 1 专利代理师 赵巧娜 (51)Int.Cl. C12Q 1/6886(2018.01) C12M 1/34(2006.01) C12M 1/00(2006.01) G16B 30/10(2019.01) (54)发明名称 肿瘤标记物及其在制备结直肠癌诊断试剂 盒中的应用 (57)摘要 本发明公开了肿瘤标记物及其在制备结直 肠癌诊断试剂盒中的应用， 属于表观遗传及肿瘤 学领域。 在本发明中， 我们研究了CRC患者肿瘤黏 膜和邻近正常黏膜中的3个不同基因IGFBP7、 BLCAP和PPIA的6个RNA编辑位点IGFBP7:chr4: 57110068、 IGFBP7:chr4:57110120、 BLCAP: chr20:37519170、 BLCAP:chr20:37519161、 BLCAP:chr20:37519131和PPIA:chr7:44802500 的编辑水平存在明显差异， 此3种不同基因与癌 症的发生发展存在关联， 并且其RNA编辑的组合 用于诊断CRC的发生具有很高的准确率。 权利要求书1页 说明书8页 附图3页 CN 115466794 A 2022.12.13 CN 115466794 A 1.一种基于RNA编辑水平的结直肠癌分子标志物， 其特征在于， 以人类参考基因组hg38 为基准， 所述分子标志物包括以下腺苷 ‑肌苷(A‑I)RNA编辑位点IGFBP7:chr4:57110068、 IGFBP7:chr4:57110120、 BLCAP:chr20:37519170、 BLCAP:chr20:37519161、 BLCAP:chr20: 37519131和P PIA:chr7:44802500。 2.权利要求1所述的结直肠癌分子标志 物在制备检测结直肠癌的产品中的应用。 3.如权利要求2所述的应用， 其特征在于， 所述产品包括但不 限于， 预测结直肠癌患者 风险等级的生物芯片、 检测结直肠癌的试剂盒。 4.一种预测结直肠癌患者风险等级的生物芯片， 其特征在于， 所述生物芯片包括固相 载体以及有序固定在所述固相载体上的寡核苷酸探针， 所述寡核苷酸探针特异 性地对应于 权利要求1所述的结直肠癌分子标志 物。 5.一种用于检测或诊断结直肠癌的装置， 其特征在于， 所述装置中， 包含特异性检测权 利要求1所述的RNA编辑位点： IGFBP7:chr4:57110068、 IGFBP7:chr4:57110120、 BLCAP: chr20:37519170、 B LCAP:chr20:37519161、 B LCAP:chr20:37519131和PPIA:chr7:44802500 的RNA编辑水平的一个或更多个装置 。 6.一种试剂 盒， 其特征在于， 所述试剂 盒中含有权利要求1所述的结直肠癌分子标志物 或含有权利要求5所述的装置， 或含有权利要求 4所述的生物芯片。 7.一种结直肠癌分子标志物在制备预测、 评估或鉴定结直肠癌患者风险等级、 指导用 药选择或疗法选择的产品中的用途， 其特征在于， 以人类参考基因组hg38为基准， 所述分子 标志物包括以下RNA编辑位点： IGFBP7:chr4:57110068、 IGFBP7:chr4:57110120、 BLCAP: chr20:37519170、 BLCAP :chr20:37519161、 BLCAP :chr20:37519131和P PIA:chr7:44802500。 8.一种检测结直肠癌分子标志物存在或水平的试剂在制备预测、 评估或鉴定结直肠癌 患者风险等级、 指导用药选择或疗法选择的产品中的用途， 其特征在于， 以人类参考基因组 hg38为基准， 所述分子标志物包括以下RNA编辑位点： IGFBP7:chr4:57110068、 IGFBP7: chr4:57110120、 B LCAP:chr20:37519170、 B LCAP:chr20:37519161、 B LCAP:chr20:37519131 和PPIA:chr7:44802500。 9.一种检测结直肠癌的试剂或试剂盒， 其特征在于， 所述试剂或试剂盒中含有能够检 测权利要求1所述的分子标志 物表达量的试剂。 10.一种判断结直肠癌风险等级的试剂或试剂 盒， 其特征在于， 所述试剂或试剂 盒中含 有能够检测权利要求1所述的分子标志 物表达量的试剂。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 115466794 A 2肿瘤标记物及其在制备结直肠癌诊断试剂盒中的应用 技术领域 [0001]本发明涉及肿瘤标记物及 其在制备结直肠癌诊断试剂盒中的应用， 属于表观遗传 及肿瘤学 领域。 背景技术 [0002]结直肠癌(colorectal  cancer， CRC)是全球第三大最常见的癌症， 也是癌症相关 死亡的第二大原因。 及时的诊断是CRC的治疗及预后的关键 。 [0003]RNA编辑属于表观遗传学的一种。 表观遗传指的是基因核苷酸序列不发生改变 的 情况下， 基因表达的可遗传改变， 其主要包括DNA甲基化、 组蛋白修饰、 非编码RNA、 RNA编辑 和基因组印记 等。 RNA编辑是改变RNA序列的重要转录后表观遗传调控。 最常见的RNA编辑类 型是腺苷脱氨酶ADAR家族介导的腺苷 ‑肌苷(A‑I)转换。 RNA编辑可以增加转录组或蛋白质 组的多样性， 并且可能改变编码的蛋白质序列或RNA的稳定性和转运。 研究表明， RNA编辑在 肿瘤或免疫等过程中起重要的调控作用。 在CRC中， RNA编辑被报道并证明与CRC的发展相 关。 A‑I编辑水平与CRC患者的生存率呈显著负相关， 表明RNA编辑对癌症治疗具有重要意 义。 在CRC中， 也有研究报道了 部分肿瘤组织和正常组织的差异RNA编辑基因及位 点。 发明内容 [0004]发明人在研究中发现， CRC患者肿瘤黏膜和邻近正常黏膜中有3个不同基因的6个 编辑位点的RNA编辑存在显著差异， 此3种不同基因与癌症的发生发展存在关联。 [0005]在本发明中， 我们研究了C RC患者肿瘤黏膜和邻近正常黏膜中的3个不同基因—— 胰岛素样生长因子结合蛋白7(insulin  like growth factor binding protein 7， IGFBP7)、 膀 胱癌相关蛋白基因(BLCAP  apoptosis inducing  factor,BLCAP)和肽酰脯氨酰 异构酶A(pep tidylprol yl isomerase  A， PPIA)的6个RNA编辑位点I GFBP7:chr4:5 7110068、 IGFBP7:chr4:57110120、 BLCAP:chr20:37519170、 BLCAP:chr20:37519161、 BLCAP:chr20: 37519131和PPIA:chr7:44802 500的编辑水平存在明显差异， 此3种不同基因与CRC的发生发 展存在关联， 并且上述6个差异RNA编辑 位点的组合用于诊断CRC的发生具有很高的准确率。 [0006]本发明提供了一种基于 RNA编辑水平的C RC分子标志物， 以人类参考基因组hg38为 基准， 所述分子标志物包括以下RNA编辑位点： IGFBP7:chr4:57110068、 IGFBP7:chr4: 57110120、 BLCAP:chr20:37519170、 BLCAP:chr20:37519161、 BLCAP:chr20:37519131和 PPIA:chr7:44802500。 [0007]在本发明的一种实施方式中， 所述RNA编辑位点： IGFBP7:chr4:57110068为， NCBI 编号为NC_000004.12的染色体上的第571 10068位。 [0008]所述RNA编辑位点： IGFBP7: chr4:57110120为， NCBI编号为NC_000004.12的染色体 上的第571 10120位。 [0009]所述RNA编辑位点： BLCAP:chr20: 37519170为， NCBI编号为NC_000020.11的染色体 上的第37519170位。说　明　书 1/8 页 3 CN 115466794 A 3